RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 SPANXN3Q5MJ09 141 aa19.5■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 PPM1LQ5SGD2 360 aa19.5■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 CES3Q6UWW8 571 aa19.5■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 TMEM135Q86UB9 458 aa19.5■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 MGARPQ8TDB4 240 aa19.5■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 CORO1BQ9BR76 489 aa19.5■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 HTATIP2Q9BUP3 242 aa19.5■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 OBSL1O75147 1896 aa19.5■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 FAM47DPA6NHR8 397 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 LPXNO60711 386 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 SPAG7O75391 227 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 CDC25CP30307 473 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 ADRA1AP35348 466 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 NUMBP49757 651 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 LRRC14Q15048 493 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 IL31Q6EBC2 164 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 OR7D4Q8NG98 312 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 MRGPRX2Q96LB1 330 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 FICDQ9BVA6 458 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 FSD1LQ9BXM9 530 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 ASAH2Q9NR71 780 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 A0A1W2PRU2 124 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 ILVBLA1L0T0 632 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 GMNCA6NCL1 334 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 ERICH4A6NGS2 130 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 UGT1A9O60656 530 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 ARHGEF15O94989 841 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 CKMP06732 381 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 MYL4P12829 197 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 ETFBP38117 255 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 DMTNQ08495 405 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 LGSNQ5TDP6 509 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 TMCO4Q5TGY1 634 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 DENND5AQ6IQ26 1287 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 Q6ZNB5 142 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 CDKL2Q92772 493 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 ZNF599Q96NL3 588 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 GCNAQ96QF7 691 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 SPON2Q9BUD6 331 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 UGT1A7Q9HAW7 530 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 UGT1A10Q9HAW8 530 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 UGT1A8Q9HAW9 530 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 PDFQ9HBH1 243 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa19.49■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa19.48■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 KRT37O76014 449 aa19.48■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 USP1O94782 785 aa19.48■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 MT-ND3P03897 115 aa19.48■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 RHOCP08134 193 aa19.48■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 GJA1P17302 382 aa19.48■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 SLC18A1P54219 525 aa19.48■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 SLC7A9P82251 487 aa19.48■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 NIPAL4Q0D2K0 466 aa19.48■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 CAMK1Q14012 370 aa19.48■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa19.48■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 RANBP10Q6VN20 620 aa19.48■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 PGBD5Q8N414 524 aa19.48■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 CHRAC1Q9NRG0 131 aa19.48■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 VPS45Q9NRW7 570 aa19.48■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 FAM169AQ9Y6X4 670 aa19.48■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 GRM6O15303 877 aa19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 TYROBPO43914 113 aa19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 RB1P06400 928 aa19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 IRS1P35568 1242 aa19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 CD86P42081 329 aa19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 WNT3AP56704 352 aa19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 DSC2Q02487 901 aa19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 KDELC1Q6UW63 502 aa19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 KDELC2Q7Z4H8 507 aa19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 TTC16Q8NEE8 873 aa19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 DYDC1Q8WWB3 177 aa19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 CERS2Q96G23 380 aa19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 CCDC134Q9H6E4 229 aa19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 MLXIPLQ9NP71 852 aa19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 CHD7Q9P2D1 2997 aa19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 SOX13Q9UN79 622 aa19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 CHD5Q8TDI0 1954 aa19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 GRXCR1A8MXD5 290 aa19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 KDELR3O43731 214 aa19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 MMP2P08253 660 aa19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 MGAT5Q09328 741 aa19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 PCSK7Q16549 785 aa19.47■□□□□ 0.71
UPP1-201ENST00000331803 STXBP5Q5T5C0 1151 aa19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.1 ms