RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318978.5

CTXN1-201, Transcript of cortexin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN1, Length 1,274 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1-201ENST00000318978 OR2A12Q8NGT7 310 aa25.99■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 OR2T34Q8NGX1 318 aa25.99■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 ACTL7AQ9Y615 435 aa25.99■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 ARHGAP33O14559 1287 aa25.98■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 DRD3P35462 400 aa25.98■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 CA9Q16790 459 aa25.98■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa25.98■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 BTBD6Q96KE9 485 aa25.98■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 DYRK4Q9NR20 520 aa25.98■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 ABHD10Q9NUJ1 306 aa25.98■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 DONSONQ9NYP3 566 aa25.98■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 IL36AQ9UHA7 158 aa25.98■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 TBC1D3EA0A087X179 549 aa25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 WASH4PA8MWX3 477 aa25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 TBC1D3LB9A6J9 549 aa25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 BUB1O43683 1085 aa25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 KDELR3O43731 214 aa25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 AKR1B10O60218 316 aa25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 MFAP3LO75121 409 aa25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 PRNPP04156 253 aa25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 CYP1A2P05177 515 aa25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 TBC1D3HP0C7X1 549 aa25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 ADPRHP54922 357 aa25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 SLC18A3Q16572 532 aa25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 CHST14Q8NCH0 376 aa25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 ARHGEF26Q96DR7 871 aa25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 ZWILCHQ9H900 591 aa25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 IP6K2Q9UHH9 426 aa25.97■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 PCDH15Q96QU1 1955 aa25.96■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 RASA4BC9J798 803 aa25.96■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 RASA4O43374 803 aa25.96■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 CTSLP07711 333 aa25.96■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 PCK1P35558 622 aa25.96■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 SSR1P43307 286 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 CNTN1Q12860 1018 aa25.96■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 PARP15Q460N3 678 aa25.96■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 CARD16Q5EG05 197 aa25.96■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 ARSIQ5FYB1 569 aa25.96■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 TMIEQ8NEW7 156 aa25.96■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 HMCESQ96FZ2 354 aa25.96■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 TM6SF2Q9BZW4 377 aa25.96■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 PLXNA2O75051 1894 aa25.96■■□□□ 1.75
CTXN1-201ENST00000318978 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 MYO1FO00160 1098 aa25.95■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 SLC7A4O43246 635 aa25.95■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 CD27P26842 260 aa25.95■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 CCDC15Q0P6D6 951 aa25.95■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 SMTNL2Q2TAL5 461 aa25.95■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 KCNT1Q5JUK3 1230 aa25.95■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 SARM1Q6SZW1 724 aa25.95■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 RFX8Q6ZV50 586 aa25.95■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 CNGA4Q8IV77 575 aa25.95■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 MINDY1Q8N5J2 469 aa25.95■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 HSPH1Q92598 858 aa25.95■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa25.95■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa25.94■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa25.94■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 CD160O95971 181 aa25.94■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 IGHV4-34P06331 123 aa25.94■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 GRIK2Q13002 908 aa25.94■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 TEAD4Q15561 434 aa25.94■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 PPM1JQ5JR12 505 aa25.94■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa25.94■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 OR2I1PQ8NGU4 316 aa25.94■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 PPP1R16AQ96I34 528 aa25.94■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 CCDC42Q96M95 316 aa25.94■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 CHP1Q99653 195 aa25.94■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 HEPHQ9BQS7 1158 aa25.94■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa25.94■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 DNAH14Q0VDD8 3507 aa25.94■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 OPHN1O60890 802 aa25.93■■□□□ 1.74
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms