RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 DCAKDQ8WVC6 231 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PAFAH2Q99487 392 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PBX4Q9BYU1 374 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC40Q9H9A6 602 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MOCS1Q9NZB8 636 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CFAP97Q9P2B7 532 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC24A2Q9UI40 661 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MYLKQ15746 1914 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 NTHL1P78549 312 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CERCAMQ5T4B2 595 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF354CQ86Y25 554 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 BBS7Q8IWZ6 715 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TTC16Q8NEE8 873 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MRGPRX2Q96LB1 330 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CYTH2Q99418 400 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 NT5MQ9NPB1 228 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MYOFQ9NZM1 2061 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 LPXNO60711 386 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PTPN2P17706 415 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 GUCY1A3Q02108 690 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PRPSAP1Q14558 356 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TMED2Q15363 201 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TEAD2Q15562 447 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHL38Q2WGJ6 581 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 GSDMBQ8TAX9 411 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ARRDC2Q8TBH0 407 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MDM1Q8TC05 714 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 WFDC5Q8TCV5 224 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MZB1Q8WU39 189 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC25A51Q9H1U9 297 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MIA3Q5JRA6 1907 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MYO9BQ13459 2157 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ILVBLA1L0T0 632 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 LEFTY2O00292 366 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TBL1XO60907 577 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ANXA9O76027 345 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ALDH1A2O94788 518 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TPH1P17752 444 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ETFBP38117 255 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 DSC2Q02487 901 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 LBRQ14739 615 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PRSS36Q5K4E3 855 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR158Q5T848 1215 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CASC4Q6P4E1 433 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 KDELC1Q6UW63 502 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 IPMKQ8NFU5 416 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TADA1Q96BN2 335 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ABHD8Q96I13 439 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 SAMD11Q96NU1 681 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PSD3Q9NYI0 1048 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PMPCBO75439 489 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 GSTA2P09210 222 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 STX2P32856 288 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 IL31Q6EBC2 164 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CES3Q6UWW8 571 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 RANBP10Q6VN20 620 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TRABD2AQ86V40 505 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CMTM8Q8IZV2 173 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 DNAAF3Q8N9W5 541 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC44A1Q8WWI5 657 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 GCNAQ96QF7 691 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PPCSQ9HAB8 311 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 UNC80Q8N2C7 3258 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 EPOPA6NHQ4 379 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM159BA6NKW6 160 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 KDELR3O43731 214 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 UGT1A9O60656 530 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM155BO75949 473 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CD160O95971 181 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 RHOCP08134 193 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PFKLP17858 780 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PGAM1P18669 254 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MPP2Q14168 576 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CRYMQ14894 314 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 CYS1Q717R9 158 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM135Q86UB9 458 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-201ENST00000284957 BHMTQ93088 406 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.2 ms