RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 FTHL17Q9BXU8 183 aa7.86□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa7.86□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 C20orf27Q9GZN8 174 aa7.86□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 GBA3Q9H227 469 aa7.86□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 C10orf88Q9H8K7 445 aa7.86□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 SPAG4Q9NPE6 437 aa7.86□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 SETD4Q9NVD3 440 aa7.86□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 PNPOQ9NVS9 261 aa7.86□□□□□ -1.15
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CAPNS1-202ENST00000586851 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 ACOT9Q9Y305 439 aa7.86□□□□□ -1.15
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CAPNS1-202ENST00000586851 SH3PXD2BA1X283 911 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 GRXCR2A6NFK2 248 aa7.85□□□□□ -1.15
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CAPNS1-202ENST00000586851 ACOT8O14734 319 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 AIM2O14862 343 aa7.85□□□□□ -1.15
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CAPNS1-202ENST00000586851 CYP3A5P20815 502 aa7.85□□□□□ -1.15
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CAPNS1-202ENST00000586851 HMOX2P30519 316 aa7.85□□□□□ -1.15
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CAPNS1-202ENST00000586851 ADARP55265 1226 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
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CAPNS1-202ENST00000586851 POU4F1Q01851 419 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 GRIK2Q13002 908 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 TTLL4Q14679 1199 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 LPIN1Q14693 890 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 MYBPC3Q14896 1274 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 HSDL1Q3SXM5 330 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM182BQ5T319 152 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 CES4AQ5XG92 561 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 FSTL4Q6MZW2 842 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 EFCAB12Q6NXP0 572 aa7.85□□□□□ -1.15
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CAPNS1-202ENST00000586851 RFX8Q6ZV50 586 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 CHSY3Q70JA7 882 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
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CAPNS1-202ENST00000586851 UBA3Q8TBC4 463 aa7.85□□□□□ -1.15
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CAPNS1-202ENST00000586851 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
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CAPNS1-202ENST00000586851 MTMR10Q9NXD2 777 aa7.85□□□□□ -1.15
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CAPNS1-202ENST00000586851 CLIC5Q9NZA1 410 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
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CAPNS1-202ENST00000586851 LOC100653049A0A140TA62 436 aa7.84□□□□□ -1.15
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CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC162PA2VCL2 907 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 ZBTB42B2RXF5 422 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 E9PBE3 544 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 H3BNH8 94 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 ZBTB14O43829 449 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 SNAP91O60641 907 aa7.84□□□□□ -1.15
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