RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	VPS51	Q9UID3	782 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	UTRN	P46939	3433 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CXCL11	O14625	94 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	MGST3	O14880	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	AR	P10275	920 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	NDUFB7	P17568	137 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	EGR1	P18146	543 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	SYT1	P21579	422 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	RARRES1	P49788	294 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	HMGCS2	P54868	508 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	HUNK	P57058	714 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	E2F1	Q01094	437 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	GPS1	Q13098	491 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CYP1B1	Q16678	543 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	LPAR1	Q92633	364 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PRR25	Q96S07	402 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PIGS	Q96S52	555 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	LAMB1	P07942	1786 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	NID2	Q14112	1375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC151	A5D8V7	595 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CES2	O00748	559 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PMPCB	O75439	489 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	DEXI	O95424	95 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	SLPI	P03973	132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	MST1	P26927	711 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CTGF	P29279	349 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	GK	P32189	559 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	DPT	Q07507	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PPIL2	Q13356	520 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	COG2	Q14746	738 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934		Q6ZWC4	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	AMER2	Q8N7J2	671 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	C12orf42	Q96LP6	360 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	SH2D4A	Q9H788	454 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934		H0YIZ8	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	QSOX1	O00391	747 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CYR61	O00622	381 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB5	O15062	677 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	STX6	O43752	255 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	FLOT1	O75955	427 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	USP1	O94782	785 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	SCG2	P13521	617 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	TYRP1	P17643	537 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	RBL1	P28749	1068 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PTH2R	P49190	550 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CCT8	P50990	548 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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