RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515183.5

SH3BP2-227, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-227ENST00000515183 EPG5Q9HCE0 2579 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 KCNK3O14649 394 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 VILLO15195 856 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 FLRT2O43155 660 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 TEX33O43247 280 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 GLDCP23378 1020 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 CHRNA3P32297 505 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 ZNF165P49910 485 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 CCT8P50990 548 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 HDAC4P56524 1084 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 PPP2CBP62714 309 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 PPP2CAP67775 309 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 GNA12Q03113 381 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 CNTN1Q12860 1018 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 ST3GAL2Q16842 350 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 ZNF423Q2M1K9 1284 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 ARTNQ5T4W7 220 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 C22orf39Q6P5X5 142 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 WDR59Q6PJI9 974 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 OR2A12Q8NGT7 310 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 SERAC1Q96JX3 654 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 OSBPL2Q9H1P3 480 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 TNKS2Q9H2K2 1166 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 DYRK4Q9NR20 520 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 ZNF212Q9UDV6 495 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 WASF3Q9UPY6 502 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-227ENST00000515183 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 SIGLEC16A6NMB1 481 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 DFNA5O60443 496 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 PRNPP04156 253 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 CTSLP07711 333 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 RHOQP17081 205 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 DESP17661 470 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 TNFAIP3P21580 790 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 CD38P28907 300 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 ETFBP38117 255 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 CTSKP43235 329 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 SLC20A2Q08357 652 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 CCDC15Q0P6D6 951 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 SLC45A4Q5BKX6 768 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 KCNT1Q5JUK3 1230 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 AGBL4Q5VU57 503 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 ACAD10Q6JQN1 1059 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 SCYL2Q6P3W7 929 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 CCDC185Q8N715 623 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 RHBDD1Q8TEB9 315 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 FAM131CQ96AQ9 280 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 MCEEQ96PE7 176 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 RETREG1Q9H6L5 497 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 IL36AQ9UHA7 158 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 DNAI1Q9UI46 699 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 MYO6Q9UM54 1294 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 TPRP12270 2363 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 NUMA1Q14980 2115 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 CACNA1EQ15878 2313 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 FAM72CH0Y354 149 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 H0Y8X5 98 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 CCP110O43303 1012 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 LATO43561 262 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 CBFA2T3O75081 653 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 LRIG2O94898 1065 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 FTH1P19P0C7X4 201 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 NUDT1P36639 197 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 MAPKAPK2P49137 400 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 DNA2P51530 1060 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 EFHC2Q5JST6 749 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 FAM72AQ5TYM5 149 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 MANEALQ5VSG8 457 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 FAM72DQ6L9T8 149 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 FAM72BQ86X60 149 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 CHST14Q8NCH0 376 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 TMIEQ8NEW7 156 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 NTAN1Q96AB6 310 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 PPP1R16AQ96I34 528 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 CDC6Q99741 560 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 CEP44Q9C0F1 390 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 PREBQ9HCU5 417 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-227ENST00000515183 HPCAL4Q9UM19 191 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms