RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC33Q8N5R6 958 aa20.52■□□□□ 0.88
SMIM20-201ENST00000506197 TERB1Q8NA31 727 aa20.52■□□□□ 0.88
SMIM20-201ENST00000506197 DCAF4L2Q8NA75 395 aa20.52■□□□□ 0.88
SMIM20-201ENST00000506197 ACTL9Q8TC94 416 aa20.52■□□□□ 0.88
SMIM20-201ENST00000506197 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.52■□□□□ 0.88
SMIM20-201ENST00000506197 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SMIM20-201ENST00000506197 SEMA4AQ9H3S1 761 aa20.52■□□□□ 0.88
SMIM20-201ENST00000506197 SP110Q9HB58 689 aa20.52■□□□□ 0.88
SMIM20-201ENST00000506197 OR51B4Q9Y5P0 310 aa20.52■□□□□ 0.88
SMIM20-201ENST00000506197 TBC1D3BA6NDS4 549 aa20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 CBX4O00257 560 aa20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 GARSP41250 739 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 NUMBP49757 651 aa20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 SULT2A1Q06520 285 aa20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 SERINC3Q13530 473 aa20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 PON2Q15165 354 aa20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 MBLAC2Q68D91 279 aa20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 TXNDC11Q6PKC3 985 aa20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 TP53INP2Q8IXH6 220 aa20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 PHTF2Q8N3S3 785 aa20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 CCNYQ8ND76 341 aa20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 FAM3CQ92520 227 aa20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 ACDQ96AP0 544 aa20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 ALG14Q96F25 216 aa20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 OLFM3Q96PB7 478 aa20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 CIPCQ9C0C6 399 aa20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 BRD8Q9H0E9 1235 aa20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 HOMER3Q9NSC5 361 aa20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 CDC23Q9UJX2 597 aa20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 FBXO4Q9UKT5 387 aa20.51■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 H7C0C1 242 aa20.5■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 KRIT1O00522 736 aa20.5■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 KDELR3O43731 214 aa20.5■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 LMNAP02545 664 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 ATP5OP48047 213 aa20.5■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 XRCC4Q13426 336 aa20.5■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF528Q3MIS6 628 aa20.5■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 NSMCE1Q8WV22 266 aa20.5■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 UCMAQ8WVF2 138 aa20.5■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 HDAC11Q96DB2 347 aa20.5■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 FAM118BQ9BPY3 351 aa20.5■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 VPS51Q9UID3 782 aa20.5■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 SLC25A13Q9UJS0 675 aa20.5■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 DMXL1Q9Y485 3027 aa20.5■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 GPR179Q6PRD1 2367 aa20.5■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 HACD1B0YJ81 288 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 TIMM44O43615 452 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 ASLP04424 464 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 DRD1P21728 446 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 IL10RBQ08334 325 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 AP1B1Q10567 949 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 FZD5Q13467 585 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 E2F5Q15329 346 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 RETSATQ6NUM9 610 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 ADIPOR2Q86V24 386 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF687Q8N1G0 1237 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 C1orf54Q8WWF1 131 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 TTC17Q96AE7 1141 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 FERMT1Q9BQL6 677 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 AP1M1Q9BXS5 423 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 ELOVL2Q9NXB9 296 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 SNAP91O60641 907 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 PRAMEF11O60813 436 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 RBP3P10745 1247 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 GLDCP23378 1020 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 CCNCP24863 283 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 TNFRSF4P43489 277 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 ECT2LQ008S8 904 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF33AQ06730 810 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 MESP2Q0VG99 397 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 CCNG2Q16589 344 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 SLC45A4Q5BKX6 768 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 TMEM196Q5HYL7 178 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC13Q8IYE1 715 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 ATG4AQ8WYN0 398 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 TSGA13Q96PP4 275 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms