RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 KIFC1Q9BW19 673 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 PBX4Q9BYU1 374 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ZYG11BQ9C0D3 744 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 HSFX1Q9UBD0 423 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 VANGL2Q9ULK5 521 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 SOX13Q9UN79 622 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 CDY1Q9Y6F8 540 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 TANC1Q9C0D5 1861 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 SCN5AQ14524 2016 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC12A8A0AV02 714 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 COPEO14579 308 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ANXA9O76027 345 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 CNTN5O94779 1100 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ABLIM3O94929 683 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 HLA-DQB2P05538 268 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 CRHR1P34998 444 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 RFC2P35250 354 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 MAGEA12P43365 314 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 SERPINB4P48594 390 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 TUFMP49411 452 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 CDH17Q12864 832 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 MTA1Q13330 715 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 IKBKEQ14164 716 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 PSMD5Q16401 504 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ALFQ53S48 1182 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 C10orf120Q5SQS8 335 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 STXBP5Q5T5C0 1151 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 GRTP1Q5TC63 336 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ARMC3Q5W041 872 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 NADSYN1Q6IA69 706 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 CASC4Q6P4E1 433 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 CES3Q6UWW8 571 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 C16orf59Q7L2K0 433 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 OTOAQ7RTW8 1153 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC00523Q86TU6 105 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 MICALL1Q8N3F8 863 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 TEX26Q8N6G2 289 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 GIPC2Q8TF65 315 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 OVCA2Q8WZ82 227 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 CDKL2Q92772 493 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 PTPRN2Q92932 1015 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 IGSF8Q969P0 613 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ISL2Q96A47 359 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 CERS2Q96G23 380 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 CLSTN3Q9BQT9 956 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 MCMBPQ9BTE3 642 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 IL22Q9GZX6 179 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 HAUS2Q9NVX0 235 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 DONSONQ9NYP3 566 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 PHTF1Q9UMS5 762 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 PSAT1Q9Y617 370 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 DNAH12Q6ZR08 3092 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 MYO16Q9Y6X6 1858 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 KLF11O14901 512 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 SEC24AO95486 1093 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 GSTA1P08263 222 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ERVK-10P10266 1014 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 OR1D2P34982 312 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 GP5P40197 560 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 GEMP55040 296 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 TJAP1Q5JTD0 557 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 MROH9Q5TGP6 573 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 KDELC1Q6UW63 502 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 RANBP10Q6VN20 620 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM47EQ6ZV65 393 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 OTOP2Q7RTS6 562 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC39A11Q8N1S5 342 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 SPATA22Q8NHS9 363 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 TOP1MTQ969P6 601 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 TADA1Q96BN2 335 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 HMCESQ96FZ2 354 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM111AQ96PZ2 611 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms