RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491592.1

RTN4-215, Transcript of reticulon 4, human

TSL 2

Gene RTN4, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RTN4-215	ENST00000491592	PGM3	O95394	542 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	GPANK1	O95872	356 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	IVL	P07476	585 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	ELANE	P08246	267 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	CSH1	P0DML2	217 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	CSH2	P0DML3	217 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	KCNA5	P22460	613 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	NR4A1	P22736	598 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	CCR9	P51686	369 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	ARFIP2	P53365	341 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	CREB5	Q02930	508 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF844	Q08AG5	666 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	MAMLD1	Q13495	774 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	MORF4L2	Q15014	288 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	IQCB1	Q15051	598 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	SPRED1	Q7Z699	444 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	COG3	Q96JB2	828 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	SPX	Q9BT56	116 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	THAP9	Q9H5L6	903 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	MAP3K5	Q99683	1374 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	PTPRM	P28827	1452 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	DLC1	Q96QB1	1528 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	TRIM38	O00635	465 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	DAB1	O75553	588 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	RPS6KA5	O75582	802 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	BEST1	O76090	585 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	ABHD16A	O95870	558 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	HMOX1	P09601	288 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	BRAF	P15056	766 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	IFNAR1	P17181	557 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	AKT1	P31749	480 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	MLH1	P40692	756 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	MAGEA8	P43361	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	RAD23A	P54725	363 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	HTD2	P86397	168 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	CCZ1B	P86790	482 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	DGCR2	P98153	550 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	MC2R	Q01718	297 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	MC1R	Q01726	317 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	EPS8	Q12929	822 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	STK4	Q13043	487 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	COASY	Q13057	564 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	TUBB2A	Q13885	445 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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