RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489095.1

TRBV5-2-201, Transcript of T cell receptor beta variable 5-2 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBV5-2, Length 273 nt, Biotype TR V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-2-201ENST00000489095 TMEM209Q96SK2 561 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 ZIC5Q96T25 663 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 GPR22Q99680 433 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 TMEM175Q9BSA9 504 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 ZYG11BQ9C0D3 744 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 SLC25A51Q9H1U9 297 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 RHOJQ9H4E5 214 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 NOD2Q9HC29 1040 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 STARD7Q9NQZ5 370 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 SNX15Q9NRS6 342 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 HEY2Q9UBP5 337 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 GGT7Q9UJ14 662 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 NR2E3Q9Y5X4 410 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 PSAT1Q9Y617 370 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 NUP205Q92621 2012 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 VWA8A3KMH1 1905 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 MIA3Q5JRA6 1907 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 HEATR9A2RTY3 570 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 CARNS1A5YM72 827 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 FCHO1O14526 889 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 SIN3BO75182 1162 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 USP12O75317 370 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 IGLV3-27P01718 113 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 LMNAP02545 664 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 AMHP03971 560 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 INHAP05111 366 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 KRT16P08779 473 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 MYL2P10916 166 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 CPA3P15088 417 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 CRABP2P29373 138 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 ADRA1AP35348 466 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 MAPKAPK2P49137 400 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 RABGGTBP53611 331 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 GPR17Q13304 367 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 PCLAFQ15004 111 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 SLC14A2Q15849 920 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 WASHC2DQ5SRD0 308 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 GALNT7Q86SF2 657 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 CLEC14AQ86T13 490 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 LMNTD2Q8IXW0 634 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 KIRREL3Q8IZU9 778 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 DCLK2Q8N568 766 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 CNTD1Q8N815 330 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 OVCA2Q8WZ82 227 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 VPS39Q96JC1 886 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 CAPNS2Q96L46 248 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 ZNF599Q96NL3 588 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 RANBP9Q96S59 729 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 MECRQ9BV79 373 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 KCNK13Q9HB14 408 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 NMUR1Q9HB89 426 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms