RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SNX18Q96RF0 628 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 S100A13Q99584 98 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 USP44Q9H0E7 712 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PTPRHQ9HD43 1115 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ABCB9Q9NP78 766 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CD93Q9NPY3 652 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TIGARQ9NQ88 270 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM9Q9P0T7 183 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CEP72Q9P209 647 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 XPR1Q9UBH6 696 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FETUBQ9UGM5 382 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SRRDQ9UH36 339 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TLL2Q9Y6L7 1015 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FAM221BA6H8Z2 402 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 EFCAB10A6NFE3 127 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 H3BMM5 538 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MTX2O75431 263 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CCNB2O95067 398 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 HSPA4LO95757 839 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GNAZP19086 355 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ADSSP30520 456 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PRKCZQ05513 592 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RTP2Q5QGT7 225 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 C16orf59Q7L2K0 433 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MICU3Q86XE3 530 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SLC22A9Q8IVM8 553 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SULF1Q8IWU6 871 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PQLC1Q8N2U9 271 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 EMC1Q8N766 993 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MB21D1Q8N884 522 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 KBTBD8Q8NFY9 601 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 HM13Q8TCT9 377 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 BPIFB1Q8TDL5 484 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GLG1Q92896 1179 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 USP7Q93009 1102 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 BOLA2Q9H3K6 86 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PARD3Q8TEW0 1356 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CABYRO75952 493 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 STAU1O95793 577 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 COL6A2P12110 1019 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ATP6V0D1P61421 351 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CHRNEQ04844 493 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MAB21L1Q13394 359 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ALG11Q2TAA5 492 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 UAP1L1Q3KQV9 507 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SEL1L3Q68CR1 1132 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FAM83AQ86UY5 434 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CDH26Q8IXH8 852 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FAM47BQ8NA70 645 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FBXL13Q8NEE6 735 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FRS2Q8WU20 508 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GTF2H4Q92759 462 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 LINGO1Q96FE5 620 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 Q96MT0 163 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 LRFN5Q96NI6 719 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GMLQ99445 158 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CHP1Q99653 195 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 UCK2Q9BZX2 261 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SAYSD1Q9NPB0 183 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GTH6 734 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PPW3 197 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PQ67 120 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 K7ERI5 159 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CDC7O00311 574 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ATP6V1B2P21281 511 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 HOXC13P31276 330 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TMPOP42166 694 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SLC15A1P46059 708 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 HNMTP50135 292 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 NUDT2P50583 147 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 HADHBP55084 474 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TSPAN5P62079 268 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 LSM3P62310 102 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PTH1RQ03431 593 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FGL1Q08830 312 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 BMPR2Q13873 1038 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PPP2R5DQ14738 602 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 DLG2Q15700 870 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SLC35F3Q8IY50 421 aa5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms