RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF124Q15973 351 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 FBXO43Q4G163 708 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 HECTD3Q5T447 861 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC30A9Q6PML9 568 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 RHOUQ7L0Q8 258 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 CHST9Q7L1S5 443 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 MDGA2Q7Z553 956 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 ADGRA1Q86SQ6 560 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 VSIG1Q86XK7 387 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 SCML4Q8N228 414 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 IL17DQ8TAD2 202 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 P2RY11Q96G91 374 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCDC34Q96HJ3 373 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 PGAM5Q96HS1 289 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 TEX12Q9BXU0 123 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRIM2Q9C040 744 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR10A4Q9H209 315 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 SH2D4AQ9H788 454 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 C20orf141Q9NUB4 165 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 TESMINQ9Y4I5 508 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 CAPN7Q9Y6W3 813 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARHGAP10A1A4S6 786 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCDC151A5D8V7 595 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 TSPY2A6NKD2 308 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 LRRC53A6NM62 1247 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 KCNJ18B7U540 433 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 LIASO43766 372 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 ENTPD3O75355 529 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 TTLL1O95922 423 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 SERPINC1P01008 464 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 TSPY3P0CV98 308 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 TSPY8P0CW00 308 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 MCCP23508 829 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 GABRB2P47870 512 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 VPS41P49754 854 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 TSPY1Q01534 308 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 RPE65Q16518 533 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 GARNL3Q5VVW2 1013 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 IL20RBQ6UXL0 311 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRSS45Q7RTY3 260 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 TICAM1Q8IUC6 712 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 GHDCQ8N2G8 530 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 SCAIQ8N9R8 606 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 KCTD6Q8NC69 237 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 HIC2Q96JB3 615 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 WDFY2Q96P53 400 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 MMS19Q96T76 1030 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 HEMGNQ9BXL5 484 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 Q9N2J8 555 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 ASNSD1Q9NWL6 643 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARL15Q9NXU5 204 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 FBXO40Q9UH90 709 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 A4GNTQ9UNA3 340 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 MAST3O60307 1309 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 CDRT15L2A8MXV6 281 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 SCAMP1O15126 338 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 TP73O15350 636 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 ADAM20O43506 726 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 ADAP00813 363 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 HEXAP06865 529 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRR35P0CG20 571 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 SAT1P21673 171 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 CD72P21854 359 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 MCM3P25205 808 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 GRIA3P42263 894 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 HSD17B4P51659 736 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 TAF11Q15544 211 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 NTRK2Q16620 822 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM266Q2M3C6 531 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 PLK5Q496M5 336 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 BMP2KLQ5H9B9 411 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 PCID2Q5JVF3 399 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 TXNDC8Q6A555 127 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 HMBOX1Q6NT76 420 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 Q6ZNX1 250 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM160B2Q86V87 743 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 RFX6Q8HWS3 928 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 C1orf210Q8IVY1 113 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-272P-201ENST00000411028 TTC9BQ8N6N2 239 aa4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 124.9 ms