RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 PPM1JQ5JR12 505 aa24.33■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 WDCPQ9H6R7 721 aa24.33■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 RAD54BQ9Y620 910 aa24.33■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa24.33■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 AP2A1O95782 977 aa24.33■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 CPA3P15088 417 aa24.33■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 ITGAXP20702 1163 aa24.33■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 BDNFP23560 247 aa24.33■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 CD52P31358 61 aa24.33■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 ZBTB17Q13105 803 aa24.33■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 ARL13BQ3SXY8 428 aa24.33■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 FSCBQ5H9T9 825 aa24.33■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 CD300LGQ6UXG3 332 aa24.33■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 CPNE1Q99829 537 aa24.33■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 CENPKQ9BS16 269 aa24.33■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 TMLHEQ9NVH6 421 aa24.33■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 OR12D3Q9UGF7 316 aa24.33■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa24.33■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 POMPQ9Y244 141 aa24.33■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 POLBP06746 335 aa24.32■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 UQCRBP14927 111 aa24.32■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 CRHR2Q13324 411 aa24.32■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 MED21Q13503 144 aa24.32■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 GRTP1Q5TC63 336 aa24.32■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa24.32■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM171BQ6P995 826 aa24.32■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 TAC4Q86UU9 113 aa24.32■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 DEFB107AQ8IZN7 70 aa24.32■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 ISL2Q96A47 359 aa24.32■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP4F11Q9HBI6 524 aa24.32■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 PADI3Q9ULW8 664 aa24.32■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa24.32■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa24.32■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 CDY1Q9Y6F8 540 aa24.32■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 BRCA2P51587 3418 aa24.32■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 GPR182O15218 404 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 NCAM2O15394 837 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 LRIG2O94898 1065 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 INHBEP58166 350 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 ITGA9Q13797 1035 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 LIN52Q52LA3 116 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 SFT2D3Q587I9 215 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 CFAP157Q5JU67 520 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 KCTD11Q693B1 232 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 PM20D1Q6GTS8 502 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 FBXW8Q8N3Y1 598 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 HASPINQ8TF76 798 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 GDPD5Q8WTR4 605 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIB2Q92519 343 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 CERS2Q96G23 380 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 RRN3Q9NYV6 651 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 ADAM28Q9UKQ2 775 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 B3GAT3O94766 335 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 F9P00740 461 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 ODC1P11926 461 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 MAGEA12P43365 314 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 RPL26P61254 145 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 GALNT2Q10471 571 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 SPANXN3Q5MJ09 141 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 LPCAT4Q643R3 524 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 FRMD7Q6ZUT3 714 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 HDAC11Q96DB2 347 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM209Q96SK2 561 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 SPATA16Q9BXB7 569 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 SNX15Q9NRS6 342 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 GSTT1P30711 240 aa24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRC36Q1X8D7 754 aa24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 RASIP1Q5U651 963 aa24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 ACBD6Q9BR61 282 aa24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 GBA3Q9H227 469 aa24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 THPOP40225 353 aa24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 CUL3Q13618 768 aa24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 EPGNQ6UW88 154 aa24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRTM3Q86VH5 581 aa24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 PHTF2Q8N3S3 785 aa24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 OR10T2Q8NGX3 314 aa24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 NCSTNQ92542 709 aa24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 PKMYT1Q99640 499 aa24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 EPAS1Q99814 870 aa24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 CASS4Q9NQ75 786 aa24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 VANGL2Q9ULK5 521 aa24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-201ENST00000369862 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms