RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 MTBPQ96DY7 904 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 PITPNM3Q9BZ71 974 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGEF4Q9NR80 690 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 MKS1Q9NXB0 559 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 KLHL14Q9P2G3 628 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 DOCK6Q96HP0 2047 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR27A2RRH5 827 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 CFAP73A6NFT4 308 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 NCAM2O15394 837 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 PI15O43692 258 aa26.05■■□□□ 1.76
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CAPNS1-204ENST00000587718 KRT4P19013 534 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXN2P32314 431 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 DCAF6Q58WW2 860 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 MDH1BQ5I0G3 518 aa26.05■■□□□ 1.76
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CAPNS1-204ENST00000587718 FGF13Q92913 245 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 CRTAC1Q9NQ79 661 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa26.05■■□□□ 1.76
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CAPNS1-204ENST00000587718 DEUP1Q05D60 604 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 GALNTL6Q49A17 601 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 SPDYAQ5MJ70 313 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 DSTYKQ6XUX3 929 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 CAPN12Q6ZSI9 719 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 IGDCC3Q8IVU1 814 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 FLCNQ8NFG4 579 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 ITFG1Q8TB96 612 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 SMARCD1Q96GM5 515 aa26.04■■□□□ 1.76
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CAPNS1-204ENST00000587718 KRT82Q9NSB4 513 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXL21Q9UKT6 434 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 TTLL3Q9Y4R7 772 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 H7C4K7 107 aa26.03■■□□□ 1.76
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CAPNS1-204ENST00000587718 CNTFP26441 200 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
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CAPNS1-204ENST00000587718 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
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CAPNS1-204ENST00000587718 IL1BP01584 269 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 APOEP02649 317 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 APRTP07741 180 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 GOT1P17174 413 aa26.03■■□□□ 1.76
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CAPNS1-204ENST00000587718 PARM1Q6UWI2 310 aa26.03■■□□□ 1.76
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CAPNS1-204ENST00000587718 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 ADRA1BP35368 520 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAJC3Q13217 504 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 ARL13BQ3SXY8 428 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 TCEAL8Q8IYN2 117 aa26.02■■□□□ 1.76
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