RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	MYL6	P60660	151 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	POSTN	Q15063	836 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	KIF19	Q2TAC6	998 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	HLA-B	Q31612	363 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	HECTD3	Q5T447	861 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM215	Q68D42	235 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	DHRS13	Q6UX07	377 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM124A	Q86V42	546 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SHISA5	Q8N114	240 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	NUP93	Q8N1F7	819 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF843	Q8N446	348 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF366	Q8N895	744 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	OTUB2	Q96DC9	234 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SMO	Q99835	787 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PRORY	Q9H606	182 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	RNF112	Q9ULX5	631 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CLIC4	Q9Y696	253 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	KNTC1	P50748	2209 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093		A0A1W2PQH9	124 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PRR19	A6NJB7	356 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	HHLA1	C9JL84	531 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093		H0Y8X5	98 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093		H3BQV1	296 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CLIC2	O15247	247 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FLRT2	O43155	660 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TGFB1I1	O43294	461 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	STC2	O76061	302 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	UBOX5	O94941	541 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	VNN1	O95497	513 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CER1	O95813	267 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CBX7	O95931	251 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TGFB1	P01137	390 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	IGLV3-19	P01714	112 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	KLKB1	P03952	638 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF883	P0CG24	379 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	HLA-E	P13747	358 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	IDE	P14735	1019 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FOSL1	P15407	271 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	GNS	P15586	552 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	GAP43	P17677	238 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CASP1	P29466	404 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ACSL1	P33121	698 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ABCD1	P33897	745 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ETFB	P38117	255 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PPP3CC	P48454	512 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TUB	P50607	506 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	MAP3K7CL	P57077	242 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TNNC1	P63316	161 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC7A5	Q01650	507 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CYP24A1	Q07973	514 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	DNAJC3	Q13217	504 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ENPP2	Q13822	863 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF234	Q14588	700 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SHB	Q15464	509 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FXN	Q16595	210 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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