RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 PLD2O14939 933 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CASC3O15234 703 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 RAD51BO15315 384 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 BIRC5O15392 142 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 DAPK3O43293 454 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PROM1O43490 865 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 KRT86O43790 486 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 B3GALT2O43825 422 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 GGPS1O95749 300 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 URODP06132 367 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 WEE2P0C1S8 567 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 MYBP10242 640 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CLUP10909 449 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 RARGP13631 454 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PRG2P13727 222 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ANPEPP15144 967 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PORP16435 677 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CTRB1P17538 263 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PRKACAP17612 351 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SDSP20132 328 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 CCR1P32246 355 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 HOXD13P35453 343 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 NR1H2P55055 460 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 GMFBP60983 142 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 ASIC1P78348 528 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ABATP80404 500 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 ARF1P84077 181 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 C17orf67Q0P5P2 114 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 SEPT8Q92599 483 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 INPP5DQ92835 1189 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 C7orf26Q96N11 449 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 TSNARE1Q96NA8 513 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 TAAR9Q96RI9 348 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CIB1Q99828 191 aa3.16□□□□□ -1.9
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