RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 C1orf186Q6ZWK4 172 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 RGL4Q8IZJ4 473 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ANKRD52Q8NB46 1076 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ACOX2Q99424 681 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 OLFM1Q99784 485 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 NDUFAF1Q9Y375 327 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 BTNL10A8MVZ5 291 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 UBDO15205 165 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ACSL4O60488 711 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SLC2A4P14672 509 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MYL12AP19105 171 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ATP4AP20648 1035 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CASP7P55210 303 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ST3GAL1Q11201 340 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PCID2Q5JVF3 399 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 LRRC38Q5VT99 294 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 VSTM1Q6UX27 236 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM26Q6ZUK4 368 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 KYQ8NBH2 561 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PROX1Q92786 737 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF670Q9BS34 389 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 HGH1Q9BTY7 390 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 KCNH1O95259 989 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 HDCP19113 662 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 POLD2P49005 469 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CNTN2Q02246 1040 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 FAXCQ5TGI0 409 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 GPR141Q7Z602 305 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SETD9Q8NE22 299 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 FBXO22Q8NEZ5 403 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 STAG3L4Q8TBR4 150 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ACMSDQ8TDX5 336 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 GAD1Q99259 594 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CAPN10Q9HC96 672 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TCF7L2Q9NQB0 619 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 E2F8A0AVK6 867 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 LAG3P18627 525 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SERPINB1P30740 379 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SMIM11AP58511 58 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGAP17Q68EM7 881 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 STRADAQ7RTN6 431 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 KAZALD1Q96I82 304 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 APOPT1Q96IL0 206 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PDP2Q9P2J9 529 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 RABGEF1Q9UJ41 708 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 A0A0A0MRY4 1105 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PIPSLA2A3N6 862 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SLC28A1O00337 649 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TSPAN3O60637 253 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ANXA5P08758 320 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 AMD1P17707 334 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PAICSP22234 425 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CLCN5P51795 746 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CDC73Q6P1J9 531 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CASP12Q6UXS9 341 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SPATA13Q96N96 652 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 KLHL41O60662 606 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 DGKIO75912 1065 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MMP3P08254 477 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF23P17027 643 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 GPD2P43304 727 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 FAM110CQ1W6H9 321 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 AGKQ53H12 422 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TIFAQ96CG3 184 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 KDELR1P24390 212 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MIPP30301 263 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CDH8P55286 799 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC157Q569K6 752 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ARMCX4Q5H9R4 360 aa6.49□□□□□ -1.37
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