RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 OSBPL6Q9BZF3 934 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 DPY30Q9C005 99 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 A0A087X1B8 175 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 GCATO75600 419 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 OR6A2O95222 327 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CATP04040 527 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 NUDT2P50583 147 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ABRQ12979 859 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CNGA2Q16280 664 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 C16orf87Q6PH81 154 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ABHD15Q6UXT9 468 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SHDQ96IW2 340 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 QRFPRQ96P65 431 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PAFAH2Q99487 392 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CDHR5Q9HBB8 845 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CLIC5Q9NZA1 410 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 OPTCQ9UBM4 332 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 POLG2Q9UHN1 485 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 LRRC72A6NJI9 287 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 JAK1P23458 1154 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 VSNL1P62760 191 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SP2Q02086 613 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 TAF10Q12962 218 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 TAF13Q15543 124 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 KCNT2Q6UVM3 1135 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 DLK2Q6UY11 383 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PARGQ86W56 976 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 HSFY1Q96LI6 401 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 RNF186Q9NXI6 227 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 STOML1Q9UBI4 398 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PRKAG3Q9UGI9 489 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SNTNA6NMZ2 147 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 RHPN2P1A8MT19 583 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 FSHRP23945 695 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CCZ1BP86790 482 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 TLE2Q04725 743 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 HSPA14Q0VDF9 509 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 GPSM1Q86YR5 675 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 BRI3BPQ8WY22 251 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SERPINB12Q96P63 405 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PLK2Q9NYY3 685 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 KLHL20Q9Y2M5 609 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 LRRC14BA6NHZ5 514 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CLCNKBP51801 687 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SLC29A2Q14542 456 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SEL1L3Q68CR1 1132 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF544Q6NX49 715 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 GATAD2AQ86YP4 633 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 TSTD1Q8NFU3 115 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 OR6K2Q8NGY2 324 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SYN3O14994 580 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 MYBL2P10244 700 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 BMPR2Q13873 1038 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CYTH1Q15438 398 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 HOMEZQ8IX15 550 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ALLCQ8N6M5 410 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 KREMEN2Q8NCW0 462 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ACTL9Q8TC94 416 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ZBTB10Q96DT7 871 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 MYO19Q96H55 970 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 EXOC2Q96KP1 924 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SCN3BQ9NY72 215 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 C16orf96A6NNT2 1141 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 QSOX1O00391 747 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CCNB1P14635 433 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 NOS3P29474 1203 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PIK3CGP48736 1102 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 STX5Q13190 355 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 TAF8Q7Z7C8 310 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 MON1AQ86VX9 555 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 HERVK_113Q902F9 699 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CNDP1Q96KN2 507 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 MID1IP1Q9NPA3 183 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 FMN2Q9NZ56 1722 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 EOMESO95936 686 aa9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms