RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513331.1

GFM2-208, Transcript of G elongation factor mitochondrial 2, human

TSL 2

Gene GFM2, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GFM2-208	ENST00000513331	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	CCT6B	Q92526	530 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	SLIT1	O75093	1534 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331		F8W810	466 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	ADAM10	O14672	748 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	TLR2	O60603	784 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	FGB	P02675	491 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	UQCRH	P07919	91 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	PEPD	P12955	493 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	PLCD1	P51178	756 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	RCAN1	P53805	252 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	SHC2	P98077	582 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	BECN1	Q14457	450 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	ETFDH	Q16134	617 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	SPATA5	Q8NB90	893 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	EVI5L	Q96CN4	794 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	PIGS	Q96S52	555 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	SYNM	O15061	1565 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	AGAP5	A6NIR3	686 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331		H0Y3Z8	333 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	MCM2	P49736	904 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	GPR162	Q16538	588 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	CTR9	Q6PD62	1173 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	TIGD1	Q96MW7	591 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	NPAS1	Q99742	590 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	KIF3A	Q9Y496	699 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	PREX2	Q70Z35	1606 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GFM2-208	ENST00000513331	ERVK-7	P63135	1459 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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