RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ILDR2Q71H61 639 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ZNF781Q8N8C0 355 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ATP6V1E2Q96A05 226 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 HPDLQ96IR7 371 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 TCF7L2Q9NQB0 619 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 TXNDC16Q9P2K2 825 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 EFR3BQ9Y2G0 817 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 HCRTO43612 131 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 GSRP00390 522 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ME2P23368 584 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 TYK2P29597 1187 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 SERPINB9P50453 376 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PCLAFQ15004 111 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 RXFP2Q8WXD0 754 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 MOCOSQ96EN8 888 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 MCRS1Q96EZ8 462 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 BIRC8Q96P09 236 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 BRD8Q9H0E9 1235 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 SPATA7Q9P0W8 599 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 EMCNQ9ULC0 261 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 CDC14AQ9UNH5 594 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PPEF2O14830 753 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 GAS2O43903 313 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 GLRA3O75311 464 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 CYP2C8P10632 490 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PIK3R1P27986 724 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 HMOX2P30519 316 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 CEACAM7Q14002 265 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 IL23RQ5VWK5 629 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 OR6B2Q6IFH4 312 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 SCYL2Q6P3W7 929 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 OLFML1Q6UWY5 402 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 SLC15A3Q8IY34 581 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ZNF786Q8N393 782 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 APBB2Q92870 758 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 MARK4Q96L34 752 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 CIB1Q99828 191 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 SGIP1Q9BQI5 828 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 SCN1AP35498 2009 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 HBP1O60381 514 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PFKMP08237 780 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 GRIA1P42261 906 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 MGAT5BQ3V5L5 792 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 FAM47BQ8NA70 645 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 FNIP1Q8TF40 1166 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ISOC1Q96CN7 298 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 KLHL32Q96NJ5 620 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 FERMT1Q9BQL6 677 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 WDR41Q9HAD4 459 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PLAC1Q9HBJ0 212 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 TMEM216Q9P0N5 145 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 TSPAN16Q9UKR8 245 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 RGSL1A5PLK6 1076 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 IL18RAPO95256 599 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 CPA3P15088 417 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PDGFRAP16234 1089 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ADORA2AP29274 412 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 SEPT6Q14141 434 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 CA9Q16790 459 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 SULF1Q8IWU6 871 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 MAPK15Q8TD08 544 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 RSAD1Q9HA92 442 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 FAM49BQ9NUQ9 324 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 IGSF9Q9P2J2 1179 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PADI4Q9UM07 663 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 NME7Q9Y5B8 376 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 CDY2AQ9Y6F7 541 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 CDY1Q9Y6F8 540 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 K7EPI3 171 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 LGALS2P05162 132 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 MCF2P10911 925 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 IDO1P14902 403 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 MAPK10P53779 464 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ZNF423Q2M1K9 1284 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 SLC9A4Q6AI14 798 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 TICAM1Q8IUC6 712 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 LRTOMTQ8WZ04 291 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PLEKHA8Q96JA3 519 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 B3GNT5Q9BYG0 378 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 MKS1Q9NXB0 559 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 GINS2Q9Y248 185 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 J3QRK9 145 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 BRCA2P51587 3418 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ARHGAP1Q07960 439 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 DCAF6Q58WW2 860 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 CENPSQ8N2Z9 138 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 FBXL8Q96CD0 374 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms