RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC57Q8N9N7 239 aa16.85■□□□□ 0.29
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TM6SF2Q9BZW4 377 aa16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DPY30Q9C005 99 aa16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RHBDL2Q9NX52 303 aa16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SH3BP4Q9P0V3 963 aa16.85■□□□□ 0.29
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDK7P50613 346 aa16.84■□□□□ 0.29
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUP188Q5SRE5 1749 aa16.84■□□□□ 0.29
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa16.83■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POLG2Q9UHN1 485 aa16.83■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEC22BO75396 215 aa16.83■□□□□ 0.28
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD52P31358 61 aa16.83■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MATKP42679 507 aa16.83■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP4Q13107 963 aa16.83■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa16.83■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIAA2013Q8IYS2 634 aa16.83■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa16.83■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CAB39LQ9H9S4 337 aa16.83■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa16.83■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BTBD7Q9P203 1132 aa16.83■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VTI1BQ9UEU0 232 aa16.83■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PEX11AO75192 247 aa16.82■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRT6AP02538 564 aa16.82■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRT6BP04259 564 aa16.82■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABHD2P08910 425 aa16.82■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRT6CP48668 564 aa16.82■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLK2P49760 499 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BNIPLQ7Z465 357 aa16.82■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPR142Q7Z601 462 aa16.82■□□□□ 0.28
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