RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 GSTM2P28161 218 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 DUSP1P28562 367 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC8A1P32418 973 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 EPHB4P54760 987 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 E2F1Q01094 437 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 ADIPOQQ15848 244 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 C9orf152Q5JTZ5 239 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 KRT80Q6KB66 452 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 PTCHD4Q6ZW05 846 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 USP51Q70EK9 711 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 TADA2BQ86TJ2 420 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 CPXM2Q8N436 756 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 RMDN1Q96DB5 314 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 CD248Q9HCU0 757 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 SNX15Q9NRS6 342 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 TRPV2Q9Y5S1 764 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1W2PPE2 198 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1W2PR64 198 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC53A6NM62 1247 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 C17orf100A8MU93 164 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 CDRT15L2A8MXV6 281 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 SNAP23O00161 211 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 TAF4O00268 1085 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 PRAMEF2O60811 474 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 SLU7O95391 586 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 KRT1P04264 644 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 TUBBP07437 444 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 RHOP08100 348 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 PRR35P0CG20 571 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 MYBL1P10243 752 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 CLK3P49761 638 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 TPTEP56180 551 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC37A1P57057 533 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 HHEXQ03014 270 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 ITIH3Q06033 890 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF618Q5T7W0 954 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 SLFN13Q68D06 897 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC186Q7Z3E2 898 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF144BQ7Z419 303 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 LGI4Q8N135 537 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 NUP93Q8N1F7 819 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 GHDCQ8N2G8 530 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 SIRT6Q8N6T7 355 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 IL17RCQ8NAC3 791 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 OR6J1Q8NGC5 347 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 MGARPQ8TDB4 240 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 HSPH1Q92598 858 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 GTF3C6Q969F1 213 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 FKBP10Q96AY3 582 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC34Q96HJ3 373 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 GBP5Q96PP8 586 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 FNBP1Q96RU3 617 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD2Q9GZV1 360 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 SFXN1Q9H9B4 322 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 USP29Q9HBJ7 922 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 GABRQQ9UN88 632 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 MARCH11A6NNE9 402 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 AP4M1O00189 453 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 ONECUT2O95948 504 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 C1RP00736 705 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 MED14OSP0DP75 135 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 POU1F1P28069 291 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 CIITAP33076 1130 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 LIG4P49917 911 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 AGTR2P50052 363 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 MMP14P50281 582 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 EFNA5P52803 228 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 OAZ1P54368 228 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 MFAP4P55083 255 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 SHC2P98077 582 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF385BQ569K4 471 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM171A1Q5VUB5 890 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 ATG9BQ674R7 924 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 DENND2CQ68D51 928 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 Q6ZRM9 215 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 LAS2Q8IYD9 372 aa6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms