RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 RSAD2Q8WXG1 361 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GATA6Q92908 595 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CAMKK2Q96RR4 588 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PHOX2BQ99453 314 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM54Q9BYV2 358 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 NYXQ9GZU5 481 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 LIN7BQ9HAP6 207 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ARNT2Q9HBZ2 717 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SAGE1Q9NXZ1 904 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
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PTPRC-209ENST00000442510 MAB21L2Q9Y586 359 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 HMX3A6NHT5 357 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FCHO1O14526 889 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PAEPP09466 180 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GSTM1P09488 218 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CYP3A7P24462 503 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PIK3R1P27986 724 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-209ENST00000442510 NAPAP54920 295 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 AQP4P55087 323 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PRPSAP1Q14558 356 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-209ENST00000442510 DHRSXQ8N5I4 330 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 LPCAT1Q8NF37 534 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SLC2A14Q8TDB8 520 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CHPT1Q8WUD6 406 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-209ENST00000442510 WDR26Q9H7D7 661 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MGAT4BQ9UQ53 548 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-209ENST00000442510 WASF2Q9Y6W5 498 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SCRIBQ14160 1630 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FAM135BQ49AJ0 1406 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CASC3O15234 703 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-209ENST00000442510 CRCPO75575 148 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 H6PDO95479 791 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CRTAMO95727 393 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PGK1P00558 417 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RARBP10826 455 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SFTPCP11686 197 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 DARSP14868 501 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-209ENST00000442510 RPS7P62081 194 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-209ENST00000442510 BRMS1LQ5PSV4 323 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SLC6A19Q695T7 634 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-209ENST00000442510 SVOPQ8N4V2 548 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 LEMD2Q8NC56 503 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 OR4D10Q8NGI6 311 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ASB15Q8WXK1 588 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CLPTM1LQ96KA5 538 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 EXOC2Q96KP1 924 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC115Q96NT0 180 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PDGFCQ9NRA1 345 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FAM86C1Q9NVL1 165 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 POLR3EQ9NVU0 708 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 UBQLN2Q9UHD9 624 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FBXL21Q9UKT6 434 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 NR2E3Q9Y5X4 410 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 POM121CA8CG34 1229 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SLC30A4O14863 429 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 STX11O75558 287 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 NELFEP18615 380 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 L1CAMP32004 1257 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SKP1P63208 163 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 REEP5Q00765 189 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF235Q14590 738 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FAM160B1Q5W0V3 765 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 DEFB107AQ8IZN7 70 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 OR2L5Q8NG80 312 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 BSNDQ8WZ55 320 aa5.68□□□□□ -1.5
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