RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 STAT4Q14765 748 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ADGRF1Q5T601 910 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 EMC10Q5UCC4 262 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC49Q8IUZ0 686 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP4X1Q8N118 509 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP11CQ8NB49 1132 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM76AQ8TAV0 307 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 STOML2Q9UJZ1 356 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 BPTFQ12830 3046 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PRU2 124 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGAP42A6NI28 874 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 FOXO6A8MYZ6 492 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.883e-6■■■□□ 15.8
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC8BQ6P9F7 803 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 MAB21L3Q8N8X9 362 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A0D9SEW6 157 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 USP12O75317 370 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 SUN1O94901 812 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 AP2A1O95782 977 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 HLA-DQB2P05538 268 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 MLNP12872 115 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ACVRL1P37023 503 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 MAPKAPK2P49137 400 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 NUMBP49757 651 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 PALM2Q8IXS6 379 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 FBF1Q8TES7 1133 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ARNTL2Q8WYA1 636 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 CORO1BQ9BR76 489 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 UBP1Q9NZI7 540 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 CPQQ9Y646 472 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 GFRA2O00451 464 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 RB1P06400 928 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 EPCAMP16422 314 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 NR1D1P20393 614 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 PBX2P40425 430 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 LMAN1P49257 510 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 CRADDP78560 199 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 SERINC3Q13530 473 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 Q6ZNB5 142 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 SPATA22Q8NHS9 363 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 FATE1Q969F0 183 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ACSS3Q9H6R3 686 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 MAN1C1Q9NR34 630 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 RAMP2O60895 175 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TSHRP16473 764 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 HPDP32754 393 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC10A7Q0GE19 358 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 PPM1LQ5SGD2 360 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC39Q96DD0 335 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC46A2Q9BY10 475 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ATXN3LQ9H3M9 355 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 DONSONQ9NYP3 566 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 LGALS13Q9UHV8 139 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 PER2O15055 1255 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP1A2P50993 1020 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 IHHQ14623 411 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 PARP15Q460N3 678 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 KDM7AQ6ZMT4 941 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 UNC5AQ6ZN44 842 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 CROCCP2Q86T23 111 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 OR52K1Q8NGK4 314 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 GLOD4Q9HC38 313 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TBK1Q9UHD2 729 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TSPAN3O60637 253 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 CDH16O75309 829 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 MOSPD3O75425 235 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 AGTP01019 485 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 MYL4P12829 197 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 EPHA5P54756 1037 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 CDH4P55283 916 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC7A9P82251 487 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 PPARDQ03181 441 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 EXOC3L1Q86VI1 746 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TCEAL4Q96EI5 215 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 CFAP36Q96G28 342 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms