RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 DCCP43146 1447 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF438Q7Z4V0 828 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 AGAP11Q8TF27 550 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 RAD21L1Q9H4I0 556 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 OR12D3Q9UGF7 316 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 CLTBP09497 229 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 USP17L7P0C7H9 530 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 HPGDP15428 266 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 GLRA2P23416 452 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 PKNOX1P55347 436 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 DGUOKQ16854 277 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 MTSS1LQ765P7 747 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 SERAC1Q96JX3 654 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 DPP7Q9UHL4 492 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 RECQL4O94761 1208 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 MYBL2P10244 700 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 DRD4P21917 467 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 OR52K1Q8NGK4 314 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 LRMDAQ9H2I8 198 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 PTPN3P26045 913 aa21.45■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 EPHX2P34913 555 aa21.45■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 GPR15P49685 360 aa21.45■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 AMPD2Q01433 879 aa21.45■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 MED8Q96G25 268 aa21.45■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF670Q9BS34 389 aa21.45■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 CATSPERZQ9NTU4 200 aa21.45■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 CPA4Q9UI42 421 aa21.45■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PARNO95453 639 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 SENP8Q96LD8 212 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ACP6Q9NPH0 428 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 FAM171A1Q5VUB5 890 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 DEPDC7Q96QD5 511 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 TMCO1Q9UM00 188 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 SNX8Q9Y5X2 465 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 FMO4P31512 558 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 MARSP56192 900 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 RHBDL3P58872 404 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 GRIK3Q13003 919 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 FAM187BQ17R55 369 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ATAD3BQ5T9A4 648 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 UNC5AQ6ZN44 842 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ADHFE1Q8IWW8 467 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PDHXO00330 501 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ALDH9A1P49189 494 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 TUFMP49411 452 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 BCL2L1Q07817 233 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 BST1Q10588 318 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PTPRHQ9HD43 1115 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 SPTLC1O15269 473 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 BIRC5O15392 142 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 CLCN5P51795 746 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 HK2P52789 917 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ARMC12Q5T9G4 340 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 IL27RAQ6UWB1 636 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 TLK2Q86UE8 772 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 YME1L1Q96TA2 773 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 MORF4L1Q9UBU8 362 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 INVSQ9Y283 1065 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 BMP10O95393 424 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 DGKAP23743 735 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PSEN2P49810 448 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 NOMO3P69849 1222 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PLD1Q13393 1074 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 IL17AQ16552 155 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ZACNQ401N2 412 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 VPS51Q9UID3 782 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 CRYL1Q9Y2S2 319 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 TRPV2Q9Y5S1 764 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 OPLAHO14841 1288 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 LGALS2P05162 132 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 BDNFP23560 247 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ADORA2AP29274 412 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ACSM2AQ08AH3 577 aa21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms