RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGMS1-211ENST00000626236 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 ATP13A1Q9HD20 1204 aa8.72□□□□□ -1.01
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SGMS1-211ENST00000626236 DTLQ9NZJ0 730 aa8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 VPS28Q9UK41 221 aa8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 FBXO10Q9UK96 956 aa8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.72□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 TBC1D3BA6NDS4 549 aa8.71□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 ARHGAP42A6NI28 874 aa8.71□□□□□ -1.02
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