RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 CLEC4CQ8WTT0 213 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 CAPN7Q9Y6W3 813 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 CLCN5P51795 746 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 GAD2Q05329 585 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 ADIGQ0VDE8 80 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 SCAPQ12770 1279 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 WSCD1Q658N2 575 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF43Q68DV7 783 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC8B1Q6J4K2 584 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC7A14Q8TBB6 771 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 POPDC2Q9HBU9 364 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM51Q9NW97 253 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 DOCK8Q8NF50 2099 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGEF37A1IGU5 675 aa26.09■■□□□ 1.77
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CAPNS1-204ENST00000587718 STK10O94804 968 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
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CAPNS1-204ENST00000587718 PRKCHP24723 683 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 PCSK1P29120 753 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 HCAR3P49019 387 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 NTHL1P78549 312 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 LGSNQ5TDP6 509 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa26.09■■□□□ 1.77
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CAPNS1-204ENST00000587718 IKBKGQ9Y6K9 419 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 CCL16O15467 120 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 HCRTO43612 131 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 ABLIM3O94929 683 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC15Q0P6D6 951 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB41Q5JT25 222 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF461Q8TAF7 563 aa26.08■■□□□ 1.77
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CAPNS1-204ENST00000587718 IRGQQ8WZA9 623 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 SYT15Q9BQS2 421 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM62Q9BVG3 475 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 BRD8Q9H0E9 1235 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 ETNK1Q9HBU6 452 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
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CAPNS1-204ENST00000587718 CHMP2BQ9UQN3 213 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 H0YHG0 523 aa26.07■■□□□ 1.76
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CAPNS1-204ENST00000587718 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 BEND5Q7L4P6 421 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 CCNJLQ8IV13 435 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC185Q8N715 623 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 SUSD3Q96L08 255 aa26.07■■□□□ 1.76
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CAPNS1-204ENST00000587718 DTLQ9NZJ0 730 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC12A4Q9UP95 1085 aa26.07■■□□□ 1.76
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CAPNS1-204ENST00000587718 INHBAP08476 426 aa26.07■■□□□ 1.76
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC26A11Q86WA9 606 aa26.07■■□□□ 1.76
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CAPNS1-204ENST00000587718 SPATA13Q96N96 652 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 MED10Q9BTT4 135 aa26.07■■□□□ 1.76
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CAPNS1-204ENST00000587718 MFSD1Q9H3U5 465 aa26.07■■□□□ 1.76
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CAPNS1-204ENST00000587718 CDH7Q9ULB5 785 aa26.07■■□□□ 1.76
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CAPNS1-204ENST00000587718 GBE1Q04446 702 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF398Q8TD17 642 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 HTR3CQ8WXA8 447 aa26.06■■□□□ 1.76
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