RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 SGK1O00141 431 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 NPM3O75607 178 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 HARS2P49590 506 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 KLF10Q13118 480 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 KCNJ8Q15842 424 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 MTERF2Q49AM1 385 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 MON1BQ7L1V2 547 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 RTL10Q7L3V2 364 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 POLNQ7Z5Q5 900 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 FIBCD1Q8N539 461 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 TMIGD2Q96BF3 282 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 TAMM41Q96BW9 452 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 HDAC11Q96DB2 347 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 DYNLL2Q96FJ2 89 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 WRNIP1Q96S55 665 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 KCNN2Q9H2S1 579 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 CAAP1Q9H8G2 361 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 JMJD4Q9H9V9 463 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 ACP6Q9NPH0 428 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 GGA3Q9NZ52 723 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 KIF17Q9P2E2 1029 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 TEX264Q9Y6I9 313 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 USP17L5A8MUK1 530 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 H3BMQ9 156 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 ST8SIA5O15466 376 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 RFPL1O75677 317 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 CHEK2O96017 543 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 NCAM1P13591 858 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 P4HA1P13674 534 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 MYF6P23409 242 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 BMXP51813 675 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 EVX2Q03828 476 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 PPP3CAQ08209 521 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 CHAC2Q8WUX2 184 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 HSPH1Q92598 858 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 COG8Q96MW5 612 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 YME1L1Q96TA2 773 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 PKP2Q99959 881 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 RMND5AQ9H871 391 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM8AQ9HCN3 771 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 PHLPP1O60346 1717 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 SHOXO15266 292 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 CHADO15335 359 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 ADAM11O75078 769 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 GLRA3O75311 464 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 HLA-DRAP01903 254 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 CYP3A4P08684 503 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF3P17036 446 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 PKLRP30613 574 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 HNF1BP35680 557 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 SLC1A6P48664 564 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 TAS2R40P59535 323 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 CNTN2Q02246 1040 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF543Q08ER8 600 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 NAB1Q13506 487 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 UBE2SQ16763 222 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 TAS1R3Q7RTX0 852 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 ANKFN1Q8N957 763 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 FEZF2Q8TBJ5 459 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 SLC22A8Q8TCC7 542 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 SLC2A14Q8TDB8 520 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 PHF12Q96QT6 1004 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 NACC1Q96RE7 527 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 CSRNP1Q96S65 589 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 BCL7BQ9BQE9 202 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 EBF4Q9BQW3 602 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM79Q9BSE2 394 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 SHANK3Q9BYB0 1731 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 PARVAQ9NVD7 372 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 PFDN2Q9UHV9 154 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 RWDD3Q9Y3V2 267 aa9□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 RNF103O00237 685 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 MAFO75444 373 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 TADA2AO75478 443 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 USP2O75604 605 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 KRT1P04264 644 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 HMGN1P05114 100 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 RALBP11234 206 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 SUSD4Q5VX71 490 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 MBLAC2Q68D91 279 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms