RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483765.5

RPL21-208, Transcript of ribosomal protein L21, human

TSL 3

Gene RPL21, Length 453 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL21-208	ENST00000483765	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RPL21-208	ENST00000483765	RNF7	Q9UBF6	113 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RPL21-208	ENST00000483765	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RPL21-208	ENST00000483765	LZTS1	Q9Y250	596 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RPL21-208	ENST00000483765	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RPL21-208	ENST00000483765	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RPL21-208	ENST00000483765	SLIT2	O94813	1529 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RPL21-208	ENST00000483765	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	PTGER1	P34995	402 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	SHC4	Q6S5L8	630 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	CPT1B	Q92523	772 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	ATP2A3	Q93084	1043 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	RAB21	Q9UL25	225 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	ADGRB3	O60242	1522 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	EEA1	Q15075	1411 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	MAP3K5	Q99683	1374 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765		F8W810	466 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	PEX14	O75381	377 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	CPA2	P48052	419 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	TRAPPC10	P48553	1259 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	IDI1	Q13907	227 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	LIPM	Q5VYY2	423 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	CCDC174	Q6PII3	467 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	ZNF347	Q96SE7	839 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	ZFYVE9	O95405	1425 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	GLI3	P10071	1580 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	PCNT	O95613	3336 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	CHKA	P35790	457 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	SHC2	P98077	582 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	B4GALNT1	Q00973	533 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	LAMB3	Q13751	1172 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	PGM5	Q15124	567 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	GALNTL6	Q49A17	601 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	RTL10	Q7L3V2	364 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	SOCS2	O14508	198 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	TCEA3	O75764	348 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	PRF1	P14222	555 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	SERPINA4	P29622	427 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	GRK6	P43250	576 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPL21-208	ENST00000483765	MCM2	P49736	904 aa		5.18	□□□□□ -1.58

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