RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384164.1

RNU6-217P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 217, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-217P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-217P-201ENST00000384164 ASIC2Q16515 512 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 DENND2CQ68D51 928 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 KIRREL2Q6UWL6 708 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 LIMS2Q7Z4I7 341 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 GALNT7Q86SF2 657 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 TMEM200AQ86VY9 491 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 ADGRF2Q8IZF7 708 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 DNAAF1Q8NEP3 725 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 HSPH1Q92598 858 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 VMP1Q96GC9 406 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 FAM89AQ96GI7 184 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 FBXL20Q96IG2 436 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 SLC38A3Q99624 504 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 NPAS1Q99742 590 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 KLHL4Q9C0H6 718 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 RABEP2Q9H5N1 569 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 SCPEP1Q9HB40 452 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 SNX15Q9NRS6 342 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 SLC22A11Q9NSA0 550 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 C20orf141Q9NUB4 165 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 TMEM74BQ9NUR3 256 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 TAB2Q9NYJ8 693 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 EHD3Q9NZN3 535 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 HSPB7Q9UBY9 170 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 AMFRQ9UKV5 643 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 GAGE12BA1L429 117 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 GAGE12HA6NDE8 117 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 MARCH11A6NNE9 402 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 C17orf100A8MU93 164 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 TTC34A8MYJ7 566 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 IFNL4K9M1U5 179 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 CTDSP2O14595 271 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 LIASO43766 372 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 STRNO43815 780 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 TBCAO75347 108 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 NXPH3O95157 252 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 SPDEFO95238 335 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 ONECUT2O95948 504 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 RB1P06400 928 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 DLDP09622 509 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 C1SP09871 688 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 MUTP22033 750 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 FPR3P25089 353 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 ITPKBP27987 946 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 POU1F1P28069 291 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 NDUFS1P28331 727 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 DUSP1P28562 367 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 CYP2C18P33260 490 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 BMPR1AP36894 532 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 NRIP1P48552 1158 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 VPS41P49754 854 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 PPP5CP53041 499 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 COPB1P53618 953 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 WDR5P61964 334 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 PRAMEP78395 509 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 PLIN5Q00G26 463 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 ABHD18Q0P651 414 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 LMAN2Q12907 356 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 TP53BP2Q13625 1128 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 CNGA3Q16281 694 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 GSTA3Q16772 222 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 EDRF1Q3B7T1 1238 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 BEAN1Q3B7T3 259 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 DPCR1Q3MIW9 517 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 RABL3Q5HYI8 236 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 RAB41Q5JT25 222 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 NUGGCQ68CJ6 796 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 GJB7Q6PEY0 223 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 SLC30A9Q6PML9 568 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 Q6ZSN1 163 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 Q6ZWC4 215 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 MOB3CQ70IA8 216 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 GPR149Q86SP6 731 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 TADA2BQ86TJ2 420 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 LINC00346Q8IVM7 164 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 CEP97Q8IW35 865 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 CPXM2Q8N436 756 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 POC5Q8NA72 575 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 SETD9Q8NE22 299 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 TFAP2BQ92481 460 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-217P-201ENST00000384164 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms