RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366960.7

RPS6KC1-202, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KC1, Length 5,490 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-202ENST00000366960 MYL4P12829 197 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 TNFRSF8P28908 595 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 ADORA2AP29274 412 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 GRIA3P42263 894 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 PDK4Q16654 411 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 ITFG1Q8TB96 612 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 RORBQ92753 470 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 SENP8Q96LD8 212 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 ANKRD27Q96NW4 1050 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 OSBPL10Q9BXB5 764 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 C2CD2Q9Y426 696 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 RAD51BO15315 384 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 XRCC4Q13426 336 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 ACAP1Q15027 740 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 SLC39A12Q504Y0 691 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 SPDYCQ5MJ68 293 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 C12orf29Q8N999 325 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 COPG2Q9UBF2 871 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 PIK3C2BO00750 1634 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 FOXO6A8MYZ6 492 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 URODP06132 367 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 ITGB5P18084 799 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 DGKZQ13574 1117 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 ARMC4Q5T2S8 1044 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 FAM45BPQ6NSW5 357 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 WNT8BQ93098 351 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 LRRC39Q96DD0 335 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 CERS2Q96G23 380 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 RNF157Q96PX1 679 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 SYBUQ9NX95 663 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 PIPSLA2A3N6 862 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 PIRTP0C851 137 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 BFSP2Q13515 415 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 SDE2Q6IQ49 451 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 RETSATQ6NUM9 610 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 ZFP1Q6P2D0 407 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 HDDC2Q7Z4H3 204 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 OOSP2Q86WS3 158 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 STMN3Q9NZ72 180 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 USP32Q8NFA0 1604 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 H3BN98 237 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 PDHXO00330 501 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 EGFRP00533 1210 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 NTRK1P04629 796 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 NFKB1P19838 968 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 EPHA3P29320 983 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 DNAJB14Q8TBM8 379 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 BTBD7Q9P203 1132 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 HACD1B0YJ81 288 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 CHADO15335 359 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 NUDT17P0C025 328 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 NOMO3P69849 1222 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 BEX3Q00994 111 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 DDR2Q16832 855 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 C9orf131Q5VYM1 1079 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 TMEM139Q8IV31 216 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 SERPINB11Q96P15 392 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 SATB2Q9UPW6 733 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 ALDH1A2O94788 518 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 YWHAQP27348 245 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 ARSHQ5FYA8 562 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 FGD3Q5JSP0 725 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 IQCKQ8N0W5 287 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 CERS5Q8N5B7 392 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 KCTD4Q8WVF5 259 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 MBOAT7Q96N66 472 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 SNTNA6NMZ2 147 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 ADM5C9JUS6 153 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 TRIM24O15164 1050 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 GOT1P17174 413 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 FEN1P39748 380 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 MMP13P45452 471 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 PIGZQ86VD9 579 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-202ENST00000366960 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms