RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 PARP15Q460N3 678 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXA4-201ENST00000360046 FAM182AQ5T1J6 154 aa22.4■■□□□ 1.18
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HOXA4-201ENST00000360046 CCDC13Q8IYE1 715 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXA4-201ENST00000360046 CCHCR1Q8TD31 782 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXA4-201ENST00000360046 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa22.4■■□□□ 1.18
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HOXA4-201ENST00000360046 LRRC3BQ96PB8 259 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXA4-201ENST00000360046 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.4■■□□□ 1.18
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HOXA4-201ENST00000360046 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
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HOXA4-201ENST00000360046 RTP4Q96DX8 246 aa22.4■■□□□ 1.18
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HOXA4-201ENST00000360046 GDF3Q9NR23 364 aa22.4■■□□□ 1.18
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HOXA4-201ENST00000360046 HEPACAM2A8MVW5 462 aa22.39■■□□□ 1.17
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HOXA4-201ENST00000360046 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM25Q86YD3 366 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 LRRC49Q8IUZ0 686 aa22.39■■□□□ 1.17
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HOXA4-201ENST00000360046 ZFP14Q9HCL3 533 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
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HOXA4-201ENST00000360046 MCM3P25205 808 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
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HOXA4-201ENST00000360046 P3H1Q32P28 736 aa22.38■■□□□ 1.17
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HOXA4-201ENST00000360046 A0A0D9SEW6 157 aa22.37■■□□□ 1.17
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HOXA4-201ENST00000360046 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 MTSS1O43312 755 aa22.37■■□□□ 1.17
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HOXA4-201ENST00000360046 TUBBP07437 444 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 RPL22P35268 128 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF33AQ06730 810 aa22.37■■□□□ 1.17
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HOXA4-201ENST00000360046 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
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HOXA4-201ENST00000360046 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 IL31Q6EBC2 164 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 TANGO2Q6ICL3 276 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 OR7D4Q8NG98 312 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 SEC14L1Q92503 715 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 IRF7Q92985 503 aa22.37■■□□□ 1.17
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HOXA4-201ENST00000360046 SPON2Q9BUD6 331 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 BBS2Q9BXC9 721 aa22.37■■□□□ 1.17
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HOXA4-201ENST00000360046 FSCBQ5H9T9 825 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 LY6G5CQ5SRR4 150 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 FYB2Q5VWT5 728 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 WFDC5Q8TCV5 224 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-201ENST00000360046 LRRC45Q96CN5 670 aa22.37■■□□□ 1.17
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