RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249700.8

TMOD2-201, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD2, Length 9,191 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-201ENST00000249700 AVPR1AP37288 418 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 HADHAP40939 763 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 TUSC3Q13454 348 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 ITGA7Q13683 1181 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 C10orf120Q5SQS8 335 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 FITM2Q8N6M3 262 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 PNPLA1Q8N8W4 532 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 KLHL5Q96PQ7 755 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 DERAQ9Y315 318 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 SEPT4O43236 478 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 OPHN1O60890 802 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 CTGFP29279 349 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 DAOAP59103 153 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 KDSRQ06136 332 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 FAM171A1Q5VUB5 890 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 CYB5D1Q6P9G0 228 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 OR10T2Q8NGX3 314 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 PSAT1Q9Y617 370 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 TMCC1O94876 653 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 KCNE1P15382 129 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 SERPINB6P35237 376 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 OTOAQ7RTW8 1153 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 CHSY1Q86X52 802 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 SPDL1Q96EA4 605 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 APOPT1Q96IL0 206 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 APOEP02649 317 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 GCKP35557 465 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 GPR15P49685 360 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 KCNJ11Q14654 390 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 POU6F1Q14863 301 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF280BQ86YH2 543 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 HPS4Q9NQG7 708 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 MTMR10Q9NXD2 777 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 HCSTQ9UBK5 93 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 VANGL2Q9ULK5 521 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 CHADO15335 359 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 TIPRLO75663 272 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 TBX18O95935 607 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 VAV1P15498 845 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 CCL23P55773 120 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 BST1Q10588 318 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF567Q8N184 647 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 SPATA6LQ8N4H0 392 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 HIPK4Q8NE63 616 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 AZIN2Q96A70 460 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 SMAPO00193 183 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 CHRNA1P02708 482 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 CYBAP13498 195 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 GATMP50440 423 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 NCALDP61601 193 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 MTFR1Q15390 333 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 SERINC5Q86VE9 423 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 SPATA22Q8NHS9 363 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 E2F7Q96AV8 911 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 CENPTQ96BT3 561 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 CCDC3Q9BQI4 270 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 TMLHEQ9NVH6 421 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 CA12O43570 354 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 SP3Q02447 781 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 DPYSL2Q16555 572 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 MFSD3Q96ES6 412 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 C5orf60A6NFR6 353 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 SPAG6O75602 509 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD2-201ENST00000249700 PTPN7P35236 360 aa6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms