RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216484.6

SPTLC2-201, Transcript of serine palmitoyltransferase long chain base subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTLC2, Length 8,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC2-201ENST00000216484 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SPTLC2-201ENST00000216484 CDH9Q9ULB4 789 aa14.84□□□□□ -0.03
SPTLC2-201ENST00000216484 TFR2Q9UP52 801 aa14.84□□□□□ -0.03
SPTLC2-201ENST00000216484 TSPAN3O60637 253 aa14.84□□□□□ -0.03
SPTLC2-201ENST00000216484 RHOCP08134 193 aa14.84□□□□□ -0.03
SPTLC2-201ENST00000216484 COX7A2P14406 83 aa14.84□□□□□ -0.03
SPTLC2-201ENST00000216484 RHOAP61586 193 aa14.84□□□□□ -0.03
SPTLC2-201ENST00000216484 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SPTLC2-201ENST00000216484 POLNQ7Z5Q5 900 aa14.84□□□□□ -0.03
SPTLC2-201ENST00000216484 CCNJLQ8IV13 435 aa14.84□□□□□ -0.03
SPTLC2-201ENST00000216484 O00370 1275 aa14.84□□□□□ -0.03
SPTLC2-201ENST00000216484 DCXO43602 365 aa14.84□□□□□ -0.03
SPTLC2-201ENST00000216484 MTTPP55157 894 aa14.84□□□□□ -0.03
SPTLC2-201ENST00000216484 MAGEC3Q8TD91 643 aa14.84□□□□□ -0.03
SPTLC2-201ENST00000216484 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.84□□□□□ -0.03
SPTLC2-201ENST00000216484 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SPTLC2-201ENST00000216484 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.03
SPTLC2-201ENST00000216484 XKR3Q5GH77 459 aa14.83□□□□□ -0.03
SPTLC2-201ENST00000216484 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
SPTLC2-201ENST00000216484 TMPRSS6Q8IU80 811 aa14.83□□□□□ -0.03
SPTLC2-201ENST00000216484 ANKFN1Q8N957 763 aa14.83□□□□□ -0.03
SPTLC2-201ENST00000216484 CRYL1Q9Y2S2 319 aa14.83□□□□□ -0.03
SPTLC2-201ENST00000216484 ARHGEF33A8MVX0 844 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 NTSP30990 170 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 CDC42P60953 191 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 BROXQ5VW32 411 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 LDHDQ86WU2 507 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 OR5T3Q8NGG3 340 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 CDRT15Q96T59 188 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 ERBB4Q15303 1308 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 FAM172BPA6NC97 362 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 A8MX80 341 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 PRKCEQ02156 737 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 NR1I3Q14994 352 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 FAM187BQ17R55 369 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 BICRALQ6AI39 1079 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 SHC4Q6S5L8 630 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 FAM131AQ6UXB0 335 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 ATG9AQ7Z3C6 839 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 OAFQ86UD1 273 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 ARMC10Q8N2F6 343 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 PIK3C3Q8NEB9 887 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 C7orf25Q9BPX7 421 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 KCNN2Q9H2S1 579 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 THAP1Q9NVV9 213 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 SLAIN2Q9P270 581 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 MYL4P12829 197 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 CDC25CP30307 473 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 S100A3P33764 101 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 PRR23CQ6ZRP0 262 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 SYT12Q8IV01 421 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 PIK3R3Q92569 461 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 TRIP11Q15643 1979 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 PNPLA4P41247 253 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 HMGCS2P54868 508 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 KAT5Q92993 513 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 H7C1W4 665 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 PLIN3O60664 434 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 NTRK1P04629 796 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 CTSEP14091 401 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 PDK2Q15119 407 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 GPSM1Q86YR5 675 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 TEX47Q8TBZ9 253 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 THAP2Q9H0W7 228 aa14.83□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 GH1P01241 217 aa14.82□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 ACO1P21399 889 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 MUTP22033 750 aa14.82□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 THPOP40225 353 aa14.82□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 TAF6P49848 677 aa14.82□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 PDX1P52945 283 aa14.82□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 TXNDC11Q6PKC3 985 aa14.82□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 CACUL1Q86Y37 369 aa14.82□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 ING5Q8WYH8 240 aa14.82□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 HTRA1Q92743 480 aa14.82□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 TRIM17Q9Y577 477 aa14.82□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 PRLP01236 227 aa14.82□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 ME2P23368 584 aa14.82□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 MAGEA12P43365 314 aa14.82□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 ARFIP1P53367 373 aa14.82□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 EPHA7Q15375 998 aa14.82□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 GRTP1Q5TC63 336 aa14.82□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa14.82□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 OR56A4Q8NGH8 313 aa14.82□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.82□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 TRIM9Q9C026 710 aa14.82□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 GSAPA4D1B5 854 aa14.82□□□□□ -0.04
SPTLC2-201ENST00000216484 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms