RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006015.3

HOXA11-201, Transcript of homeobox A11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA11, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11-201ENST00000006015 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ZPBP2Q6X784 338 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 PDZD7Q9H5P4 517 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 CAAP1Q9H8G2 361 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 TBC1D23Q9NUY8 699 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 C7orf72A4D263 438 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 ACOT8O14734 319 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 PDGFRBP09619 1106 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 GARSP41250 739 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 CLCN3P51790 818 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 NAA20P61599 178 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 SEMA5AQ13591 1074 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 PPM1JQ5JR12 505 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 IER5Q5VY09 327 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 PFDN4Q9NQP4 134 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 KPNA7A9QM74 516 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 C8BP07358 591 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 IL4RP24394 825 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 GRIA1P42261 906 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 NDST2P52849 883 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 IGBP1P78318 339 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 ORC1Q13415 861 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 STILQ15468 1287 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 NRF1Q16656 503 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 DUOXA2Q1HG44 320 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 EEF1DP3Q658K8 133 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 CASC4Q6P4E1 433 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 COX4I2Q96KJ9 171 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 INIPQ9NRY2 104 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 TADA2AO75478 443 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 MAP3K6O95382 1288 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 IQCF3P0C7M6 154 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 MLNP12872 115 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 CD1EP15812 388 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 PFKPQ01813 784 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 GSTM4Q03013 218 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 IKBKEQ14164 716 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 GRAMD4Q6IC98 578 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 GPR141Q7Z602 305 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 SLC35B4Q969S0 331 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 TMEM79Q9BSE2 394 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 TXNDC16Q9P2K2 825 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 OGTO15294 1046 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 HMOX2P30519 316 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 RAP1GAPP47736 663 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 EFNA5P52803 228 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 ESRRGP62508 458 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 ART3Q13508 389 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 NAPRTQ6XQN6 538 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 RNF148Q8N7C7 305 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 PCDH19Q8TAB3 1148 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 MAF1Q9H063 256 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 COQ10BQ9H8M1 238 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 EFCAB1Q9HAE3 211 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 SLC8A2Q9UPR5 921 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 PSAT1Q9Y617 370 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 GOLGA8OA6NCC3 632 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 C2CD4BA6NLJ0 364 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 GOLGA8NF8WBI6 632 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 HOXC6P09630 235 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 PGAM1P18669 254 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 DPP6P42658 865 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 HK2P52789 917 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 BOLA3Q53S33 107 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 IL23RQ5VWK5 629 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 GPR180Q86V85 440 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 ISOC1Q96CN7 298 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF385DQ9H6B1 395 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 OLAHQ9NV23 265 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 CDH7Q9ULB5 785 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 MCM3APO60318 1980 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 MATN2O00339 956 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 TRIM38O00635 465 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 DGKIO75912 1065 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 OXCT1P55809 520 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 EFCAB12Q6NXP0 572 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA11-201ENST00000006015 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms