RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 TFAP2BQ92481 460 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 LGMNQ99538 433 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 CHSY1Q86X52 802 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 HSCBQ8IWL3 235 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 APCDD1Q8J025 514 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF843Q8N446 348 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC35F5Q8WV83 523 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM149B1Q96BN6 582 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 TJP2Q9UDY2 1190 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 TLR6Q9Y2C9 796 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGEC1O60732 1142 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 GABBR2O75899 941 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXO21O94952 628 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 DAB2P98082 770 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 HS1BP3Q53T59 392 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 SPACA3Q8IXA5 215 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPRN2Q92932 1015 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 COQ4Q9Y3A0 265 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 LATO43561 262 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 RTN2O75298 545 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 APOEP02649 317 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 PAEPP09466 180 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 VAV1P15498 845 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 BRD2P25440 801 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 TLE3Q04726 772 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 STAT4Q14765 748 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D25Q3MII6 688 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 RAP1GAP2Q684P5 730 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 KRBA2Q6ZNG9 492 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 UBR7Q8N806 425 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 TSG101Q99816 390 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 CYTH4Q9UIA0 394 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 MT-CO3P00414 261 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 ACP1P24666 158 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 DRD3P35462 400 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 METAP1P53582 386 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 CFHR1Q03591 330 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 HSFY1Q96LI6 401 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 ST7Q9NRC1 585 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 C10orf142B7Z368 130 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SIGLEC6O43699 453 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 PDGFRAP16234 1089 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 TACR2P21452 398 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 CNGA2Q16280 664 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 PROX2Q3B8N5 592 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 DSG4Q86SJ6 1040 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 TAC4Q86UU9 113 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 IQCHQ86VS3 1027 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 ERICH1Q86X53 443 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 RFFLQ8WZ73 363 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SPAG5Q96R06 1193 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 DMTF1Q9Y222 760 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SHROOM3Q8TF72 1996 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 CALCAP01258 141 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 NUDT1P36639 197 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 E2F1Q01094 437 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 OVGP1Q12889 678 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 NNTQ13423 1086 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 STILQ15468 1287 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 POM121L1PQ3SYA9 428 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 OR8D1Q8WZ84 308 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SNX21Q969T3 373 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC39A13Q96H72 371 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 NT5C1BQ96P26 610 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 KDM4CQ9H3R0 1056 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 CA5BQ9Y2D0 317 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
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CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM38O00635 465 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 FYNP06241 537 aa28.22■■■□□ 2.11
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CAPNS1-217ENST00000629983 KCNH2Q12809 1159 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 ACCSLQ4AC99 568 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 BROXQ5VW32 411 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM46CQ5VWP2 391 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 PPM1KQ8N3J5 372 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF248Q8NDW4 579 aa28.22■■■□□ 2.11
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CAPNS1-217ENST00000629983 ZSWIM1Q9BR11 485 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 KALRNO60229 2985 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 F5H5T6 163 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC7A4O43246 635 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SART1O43290 800 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
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