RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 VAT1Q99536 393 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 C10orf88Q9H8K7 445 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 ARFGAP3Q9NP61 516 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 NFU1Q9UMS0 254 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGAP42A6NI28 874 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 SMAPO00193 183 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 GFRA2O00451 464 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 CEBPBP17676 345 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 IRAK1P51617 712 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 GPS1Q13098 491 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAM15Q13444 863 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 TRADDQ15628 312 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 PARP15Q460N3 678 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 ATPAF2Q8N5M1 289 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 SH3RF2Q8TEC5 729 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 P2RY11Q96G91 374 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC39A8Q9C0K1 460 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 NDFIP2Q9NV92 336 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 OR1E1P30953 314 aa31.82■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL22P35268 128 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 CLCN6P51797 869 aa31.82■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa31.82■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC13Q8IYE1 715 aa31.82■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ART4Q93070 314 aa31.82■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 FATE1Q969F0 183 aa31.82■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 MYBL2P10244 700 aa31.81■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ETS1P14921 441 aa31.81■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 VAV1P15498 845 aa31.81■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ECHS1P30084 290 aa31.81■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa31.81■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 TBC1D14Q9P2M4 693 aa31.81■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0A0MRY4 1105 aa31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 DFFAO00273 331 aa31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 OPHN1O60890 802 aa31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 RAMP2O60895 175 aa31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 FSHRP23945 695 aa31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 VPS41P49754 854 aa31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 USP4Q13107 963 aa31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 MPP7Q5T2T1 576 aa31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 C6orf118Q5T5N4 469 aa31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 TP53INP2Q8IXH6 220 aa31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ITFG1Q8TB96 612 aa31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 MYEOVQ96EZ4 313 aa31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATA13Q96N96 652 aa31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPYL1Q9H0U9 437 aa31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 MAGEH1Q9H213 219 aa31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 DOCK8Q8NF50 2099 aa31.79■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 DENND4AQ7Z401 1863 aa31.79■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 IZUMO3Q5VZ72 239 aa31.79■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 SYCE2Q6PIF2 218 aa31.79■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa31.79■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC33Q8N5R6 958 aa31.79■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 OTUB2Q96DC9 234 aa31.79■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 FMO2Q99518 471 aa31.79■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXP3Q9BZS1 431 aa31.79■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 RASA4BC9J798 803 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 RASA4O43374 803 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 PLTPP55058 493 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS24P62847 133 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 MORF4L2Q15014 288 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF77Q15935 545 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 MPPE1Q53F39 396 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ZDHHC24Q6UX98 284 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF783Q6ZMS7 281 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 CFAP52Q8N1V2 620 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAM7Q9H2U9 754 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 GDE1Q9NZC3 331 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ANAPC5Q9UJX4 755 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 TRHDEQ9UKU6 1024 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 CCL26Q9Y258 94 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC01565O15544 149 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 MAFKO60675 156 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ETFBP38117 255 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ITGA8P53708 1063 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ANO4Q32M45 955 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 PRUNE1Q86TP1 453 aa31.78■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms