RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581180.1

MKS1-210, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 2

Gene MKS1, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-210ENST00000581180 ADIPOR2Q86V24 386 aa15.52■□□□□ 0.08
MKS1-210ENST00000581180 VSIG1Q86XK7 387 aa15.52■□□□□ 0.08
MKS1-210ENST00000581180 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
MKS1-210ENST00000581180 KCTD6Q8NC69 237 aa15.52■□□□□ 0.08
MKS1-210ENST00000581180 PJA1Q8NG27 643 aa15.52■□□□□ 0.08
MKS1-210ENST00000581180 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa15.52■□□□□ 0.08
MKS1-210ENST00000581180 CSPG4P5Q96PW8 444 aa15.52■□□□□ 0.08
MKS1-210ENST00000581180 ZNF670Q9BS34 389 aa15.52■□□□□ 0.08
MKS1-210ENST00000581180 KLC2Q9H0B6 622 aa15.52■□□□□ 0.08
MKS1-210ENST00000581180 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
MKS1-210ENST00000581180 AMFRQ9UKV5 643 aa15.52■□□□□ 0.08
MKS1-210ENST00000581180 HCN2Q9UL51 889 aa15.52■□□□□ 0.08
MKS1-210ENST00000581180 STARD13Q9Y3M8 1113 aa15.52■□□□□ 0.08
MKS1-210ENST00000581180 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa15.52■□□□□ 0.08
MKS1-210ENST00000581180 KMT2EQ8IZD2 1858 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 TBC1D3BA6NDS4 549 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 USP27XA6NNY8 438 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 ZNF487B1APH4 448 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 DCLK1O15075 740 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 FTCDO95954 541 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 TNNT1P13805 278 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 AMPD1P23109 780 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 OR1E1P30953 314 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 CSKP41240 450 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 OXCT1P55809 520 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 SLC12A1Q13621 1099 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 PLEKHG6Q3KR16 790 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 FUT11Q495W5 492 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 DGKKQ5KSL6 1271 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 C6orf118Q5T5N4 469 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 ZNF783Q6ZMS7 281 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 PEX26Q7Z412 305 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 CCDC105Q8IYK2 499 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 KATNAL2Q8IYT4 538 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 APCDD1Q8J025 514 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 AHI1Q8N157 1196 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 CLDN23Q96B33 292 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 C11orf16Q9NQ32 467 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 ZNF318Q5VUA4 2279 aa15.51■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 ILVBLA1L0T0 632 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 CCDC66A2RUB6 948 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 LRRD1A4D1F6 860 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 KRT1P04264 644 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 RHOCP08134 193 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 DMC1Q14565 340 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 TAZQ16635 292 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 FBXO43Q4G163 708 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 PITRM1Q5JRX3 1037 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 MBLAC2Q68D91 279 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 MAP7D3Q8IWC1 876 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 SYNPOQ8N3V7 929 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 FLCNQ8NFG4 579 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 PCDH19Q8TAB3 1148 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 ALG3Q92685 438 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 TTC17Q96AE7 1141 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 HES6Q96HZ4 224 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 FEM1AQ9BSK4 669 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 MFSD1Q9H3U5 465 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 LMAN1LQ9HAT1 526 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 KCND1Q9NSA2 647 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 ETNK2Q9NVF9 386 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 ELOVL2Q9NXB9 296 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 DNAI1Q9UI46 699 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 A0A0D9SEW6 157 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 STK25O00506 426 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 DAPK3O43293 454 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 PI15O43692 258 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 AOC1P19801 751 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 GNA12Q03113 381 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 LRRC32Q14392 662 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 MEI1Q5TIA1 1274 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 EMC10Q5UCC4 262 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 AFMIDQ63HM1 303 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 MFSD7Q6UXD7 560 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 NUDT18Q6ZVK8 323 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 NPWQ8N729 165 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 PQLC3Q8N755 202 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 TRIM58Q8NG06 486 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 OR7D4Q8NG98 312 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 EXD1Q8NHP7 514 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 PBXIP1Q96AQ6 731 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 RNF157Q96PX1 679 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 ALS2CR12Q96Q35 445 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 PSMB7Q99436 277 aa15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms