RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 MGAT1P26572 445 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 OR1E1P30953 314 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 LSP1P33241 339 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 SARNPP82979 210 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 SEMA5AQ13591 1074 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 PARP6Q2NL67 630 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 HECTD3Q5T447 861 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 MSANTD2Q6P1R3 559 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 ZNF534Q76KX8 674 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 TAOK1Q7L7X3 1001 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 CNTD1Q8N815 330 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 PPM1NQ8N819 430 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 HDAC11Q96DB2 347 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 PAFAH2Q99487 392 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 TMEM120BA0PK00 339 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 SMAPO00193 183 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 TLL1O43897 1013 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 TSPAN3O60637 253 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 ABLIM3O94929 683 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 CXCL14O95715 111 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 CSH1P0DML2 217 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 CSH2P0DML3 217 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 GCAP28676 217 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 FDFT1P37268 417 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 ETFBP38117 255 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 MSH2P43246 934 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 HARS2P49590 506 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 MAXP61244 160 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 RPS24P62847 133 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 FPGSQ05932 587 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 TXNDC8Q6A555 127 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 CROCCP2Q86T23 111 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 LGI2Q8N0V4 545 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 GDAP1Q8TB36 358 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 DYDC1Q8WWB3 177 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 HMCESQ96FZ2 354 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 SLC22A12Q96S37 553 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 TMEM109Q9BVC6 243 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 ZYG11BQ9C0D3 744 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 A0A1W2PPM1 405 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 J3KR12 359 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 EFCAB14O75071 495 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 PMPCBO75439 489 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 EFEMP2O95967 443 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 F7P08709 466 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 ABHD2P08910 425 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 MANEALQ5VSG8 457 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 IPMKQ8NFU5 416 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 MCOLN1Q9GZU1 580 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 SLC17A6Q9P2U8 582 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.61□□□□□ -1.031e-6■■■■□ 21.1
CS-215ENST00000549143 TGM5O43548 720 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 UGT1A9O60656 530 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 MAFKO60675 156 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 INHBAP08476 426 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 ATP5DP30049 168 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 PPM1AP35813 382 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 EPHB3P54753 998 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 SKOR1P84550 965 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 PCSK7Q16549 785 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 PLPP4Q5VZY2 271 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 TPGS2Q68CL5 300 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 NADSYN1Q6IA69 706 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 C4orf22Q6V702 233 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 UNC5AQ6ZN44 842 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 PSMG2Q969U7 264 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 SIGLEC10Q96LC7 697 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 TEKT5Q96M29 485 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 CYTH2Q99418 400 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 TCF25Q9BQ70 676 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 SPON2Q9BUD6 331 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 ACSS3Q9H6R3 686 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 UGT1A7Q9HAW7 530 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 UGT1A10Q9HAW8 530 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 UGT1A8Q9HAW9 530 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa8.61□□□□□ -1.03
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