RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544662.1

PUS1-211, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene PUS1, Length 836 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-211ENST00000544662 ANKRD62A6NC57 917 aa22.49■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.191e-15■■■■□ 20.6
PUS1-211ENST00000544662 SRGAP2O75044 1071 aa22.49■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 HDAC4P56524 1084 aa22.49■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 ZBED6P86452 979 aa22.49■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 ARL13BQ3SXY8 428 aa22.49■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 ARMCX6Q7L4S7 300 aa22.49■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 CYP2U1Q7Z449 544 aa22.49■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 DNAAF5Q86Y56 855 aa22.49■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 DEFB119Q8N690 84 aa22.49■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 ALG14Q96F25 216 aa22.49■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.49■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 FEM1AQ9BSK4 669 aa22.49■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 FBRSQ9HAH7 460 aa22.49■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 ITM2CQ9NQX7 267 aa22.49■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 MPP6Q9NZW5 540 aa22.49■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa22.49■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 CAPN11Q9UMQ6 739 aa22.49■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 TTC34A8MYJ7 566 aa22.48■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 AP5Z1O43299 807 aa22.48■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 CCP110O43303 1012 aa22.48■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 TPM3P06753 285 aa22.48■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 ACADMP11310 421 aa22.48■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 GZMAP12544 262 aa22.48■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 PTGER3P43115 390 aa22.48■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 STK19P49842 368 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 TPMTP51580 245 aa22.48■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 SULT2A1Q06520 285 aa22.48■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 SPDYCQ5MJ68 293 aa22.48■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 HGSNATQ68CP4 663 aa22.48■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 DCUN1D2Q6PH85 259 aa22.48■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 VPS45Q9NRW7 570 aa22.48■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 OR51B4Q9Y5P0 310 aa22.48■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.48■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 SIN3BO75182 1162 aa22.47■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 NDUFS2O75306 463 aa22.47■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 FTLP02792 175 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 RHOCP08134 193 aa22.47■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 CD6P30203 668 aa22.47■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 RPS14P62263 151 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 ARID5BQ14865 1188 aa22.47■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa22.47■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 CCDC185Q8N715 623 aa22.47■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 RNF214Q8ND24 703 aa22.47■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 PIGKQ92643 395 aa22.47■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 ZYG11BQ9C0D3 744 aa22.47■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 MUC3BQ9H195 1237 aa22.47■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 VPS28Q9UK41 221 aa22.47■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa22.46■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 RTN2O75298 545 aa22.46■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 GYPCP04921 128 aa22.46■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 C7P10643 843 aa22.46■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 ARHGAP8P85298 464 aa22.46■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 OGDHQ02218 1023 aa22.46■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 MAMLD1Q13495 774 aa22.46■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 LYSMD4Q5XG99 296 aa22.46■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa22.46■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 RMDN1Q96DB5 314 aa22.46■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 CNPY3Q9BT09 278 aa22.46■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 MAGEB5Q9BZ81 275 aa22.46■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 OSBPL2Q9H1P3 480 aa22.46■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 PARVAQ9NVD7 372 aa22.46■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 OR12D3Q9UGF7 316 aa22.46■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PUS1-211ENST00000544662 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa22.45■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 CBFA2T2O43439 604 aa22.45■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 IGLV3-19P01714 112 aa22.45■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 OXTRP30559 389 aa22.45■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 CASP14P31944 242 aa22.45■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 NNMTP40261 264 aa22.45■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 ID4P47928 161 aa22.45■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 C9orf64Q5T6V5 341 aa22.45■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 MANEALQ5VSG8 457 aa22.45■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 TCEAL6Q6IPX3 200 aa22.45■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa22.45■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 TCEAL3Q969E4 200 aa22.45■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 NTAN1Q96AB6 310 aa22.45■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 ZNF212Q9UDV6 495 aa22.45■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 SLC25A13Q9UJS0 675 aa22.45■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.18
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