RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 LSMEM2Q8N112 164 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC185Q8N715 623 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PLD5Q8N7P1 536 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 FBF1Q8TES7 1133 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 ERP27Q96DN0 273 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SMARCD1Q96GM5 515 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SEC16BQ96JE7 1060 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 LGMNQ99538 433 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 MAGEB5Q9BZ81 275 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 POPDC2Q9HBU9 364 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM17Q9Y577 477 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 H0YGN5 161 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 DFFAO00273 331 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 CHRNA1P02708 482 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 HMBSP08397 361 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 CREB1P16220 341 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SERPINB4P48594 390 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 GAD2Q05329 585 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 KLHL38Q2WGJ6 581 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 UBXN11Q5T124 520 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SDHAF4Q5VUM1 108 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 LONP2Q86WA8 852 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 LURAP1LQ8IV03 231 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 CRYBG2Q8N1P7 616 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM86AQ8N2M4 240 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 MYLPFQ96A32 169 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 CYTH2Q99418 400 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 UQCC2Q9BRT2 126 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC28BQ9BUN5 200 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 CHST12Q9NRB3 414 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 MIOSQ9NXC5 875 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 NFS1Q9Y697 457 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 USH1CQ9Y6N9 552 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 DNAH12Q6ZR08 3092 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TRIP11Q15643 1979 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 OTOFQ9HC10 1997 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 MYO7AQ13402 2215 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 KANSL1LA0AUZ9 987 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 HAS3O00219 553 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 C2CD2LO14523 706 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 BEST1O76090 585 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 CYBAP13498 195 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 KRT4P19013 534 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PRKACBP22694 351 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 ACLYP53396 1101 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 MGAT5BQ3V5L5 792 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 C6orf183Q5T699 404 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SYPL2Q5VXT5 272 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 DEFB128Q7Z7B8 93 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PCDH19Q8TAB3 1148 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SLC35B2Q8TB61 432 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 WNT8BQ93098 351 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TTC17Q96AE7 1141 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA16Q9BXB7 569 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SLC13A1Q9BZW2 595 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PARP14Q460N5 1801 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 YJEFN3A6XGL0 299 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SERPINB7O75635 380 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 STAU1O95793 577 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TUSC3Q13454 348 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SPARCL1Q14515 664 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 NOMO1Q15155 1222 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 OASLQ15646 514 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SLC39A12Q504Y0 691 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 AGMOQ6ZNB7 445 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 C4orf50Q6ZRC1 276 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SERINC5Q86VE9 423 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 MIB1Q86YT6 1006 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 CPT1BQ92523 772 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 CDKL2Q92772 493 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SLCO2A1Q92959 643 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 APOL2Q9BQE5 337 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PITPNM3Q9BZ71 974 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TRPC7Q9HCX4 862 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 GDAP2Q9NXN4 497 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 KLHL14Q9P2G3 628 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
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