RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 ANO4Q32M45 955 aa22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 C6orf118Q5T5N4 469 aa22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 FERMT1Q9BQL6 677 aa22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 RHOXF2Q9BQY4 288 aa22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 KLC2Q9H0B6 622 aa22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.61■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 HACD1B0YJ81 288 aa22.61■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 RAD51CO43502 376 aa22.61■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 GAS8O95995 478 aa22.61■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 ITGAVP06756 1048 aa22.61■■□□□ 1.21
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PSPC1-204ENST00000492741 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.61■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.61■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 IRF7Q92985 503 aa22.61■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 OLFM3Q96PB7 478 aa22.61■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 LGMNQ99538 433 aa22.61■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 SPHK2Q9NRA0 654 aa22.61■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 ARHGAP42A6NI28 874 aa22.6■■□□□ 1.21
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PSPC1-204ENST00000492741 MPP7Q5T2T1 576 aa22.6■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 MFN1Q8IWA4 741 aa22.6■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa22.6■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 ATPAF2Q8N5M1 289 aa22.6■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 KXD1Q9BQD3 176 aa22.6■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 BBS2Q9BXC9 721 aa22.6■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF212Q9UDV6 495 aa22.6■■□□□ 1.21
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PSPC1-204ENST00000492741 KCNN4O15554 427 aa22.6■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 RASA4O43374 803 aa22.6■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 MBTPS2O43462 519 aa22.6■■□□□ 1.21
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PSPC1-204ENST00000492741 LY6G5CQ5SRR4 150 aa22.6■■□□□ 1.21
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PSPC1-204ENST00000492741 VITQ6UXI7 678 aa22.6■■□□□ 1.21
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PSPC1-204ENST00000492741 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.6■■□□□ 1.21
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PSPC1-204ENST00000492741 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa22.59■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 STIP1P31948 543 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
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PSPC1-204ENST00000492741 PARP15Q460N3 678 aa22.59■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 MTSS1LQ765P7 747 aa22.59■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 CCDC89Q8N998 374 aa22.59■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 FAM71DQ8N9W8 422 aa22.59■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.59■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 ELSPBP1Q96BH3 223 aa22.59■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 HMCESQ96FZ2 354 aa22.59■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 ZFYVE19Q96K21 471 aa22.59■■□□□ 1.21
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PSPC1-204ENST00000492741 IL31Q6EBC2 164 aa22.58■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 JAMLQ86YT9 394 aa22.58■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 LRRC49Q8IUZ0 686 aa22.58■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 ALLCQ8N6M5 410 aa22.58■■□□□ 1.21
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PSPC1-204ENST00000492741 MAGEH1Q9H213 219 aa22.58■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa22.58■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 ILVBLA1L0T0 632 aa22.57■■□□□ 1.2
PSPC1-204ENST00000492741 FAM187AA6NFU0 413 aa22.57■■□□□ 1.2
PSPC1-204ENST00000492741 NFATC1O95644 943 aa22.57■■□□□ 1.2
PSPC1-204ENST00000492741 PTGIRP43119 386 aa22.57■■□□□ 1.2
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