RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486941.1

SNRNP40-205, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 2

Gene SNRNP40, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-205	ENST00000486941	GABRD	O14764	452 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	TRIAP1	O43715	76 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	ARIH2	O95376	493 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	GH1	P01241	217 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	CXCL10	P02778	98 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	MYBL2	P10244	700 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF134	P52741	427 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC16A1	P53985	500 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	PDE1A	P54750	535 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	MTMR1	Q13613	665 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	GPNMB	Q14956	572 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	PTGIS	Q16647	500 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	KAT2B	Q92831	832 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM122A	Q96E09	287 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	IWS1	Q96ST2	819 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	CERS4	Q9HA82	394 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	SI	P14410	1827 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	ABCB11	O95342	1321 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941		A0A0D9SFI3	127 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	DCLK1	O15075	740 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	GJB5	O95377	273 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	MMP3	P08254	477 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	HAND2	P61296	217 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	ARHGAP1	Q07960	439 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	STXBP2	Q15833	593 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	LY6K	Q17RY6	165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	USH1G	Q495M9	461 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	IQCA1	Q86XH1	822 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	WASF1	Q92558	559 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	ESR2	Q92731	530 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	RAD9A	Q99638	391 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	LAMA4	Q16363	1823 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	LINC01553	A4QN01	128 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	MYO1F	O00160	1098 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	HAS3	O00219	553 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	PPP6C	O00743	305 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	NBN	O60934	754 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	NTN1	O95631	604 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	TGFB3	P10600	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	DEFB103A	P81534	67 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	GHRHR	Q02643	423 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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