RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 PASD1Q8IV76 773 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 STK40Q8N2I9 435 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 WDTC1Q8N5D0 677 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 SLC6A18Q96N87 628 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 FAM129BQ96TA1 746 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 POPDC2Q9HBU9 364 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 SGK2Q9HBY8 427 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 TAB2Q9NYJ8 693 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 COX16Q9P0S2 106 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 DOCK9Q9BZ29 2069 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 FAM170AA1A519 330 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 SART1O43290 800 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 GRAP2O75791 330 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 APOEP02649 317 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 ASLP04424 464 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 WNT1P04628 370 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 PDGFRAP16234 1089 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 SLC8A1P32418 973 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 GGCXP38435 758 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 CTSKP43235 329 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 GRIA4P48058 902 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 IRAK1P51617 712 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 METAP1P53582 386 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 COPB1P53618 953 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 ECT2LQ008S8 904 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 CENPCQ03188 943 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 PDCLQ13371 301 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 TEAD4Q15561 434 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 TRIM65Q6PJ69 517 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 SARM1Q6SZW1 724 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 DEFB106AQ8N104 65 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 AADATQ8N5Z0 425 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 STK32AQ8WU08 396 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 CPXM1Q96SM3 734 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 OSGEPQ9NPF4 335 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 CEP83Q9Y592 693 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 LAMA5O15230 3695 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 LRRC10BA6NIK2 292 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 KCNU1A8MYU2 1149 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 FLRT2O43155 660 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 MED7O43513 233 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 CCDC157Q569K6 752 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 USP30Q70CQ3 517 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 BEND5Q7L4P6 421 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 PROSER1Q86XN7 944 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 OR52K2Q8NGK3 314 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 MDM1Q8TC05 714 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 PTPRN2Q92932 1015 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 IGSF8Q969P0 613 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 BTN2A3PQ96KV6 586 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 OMDQ99983 421 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 FAM204AQ9H8W3 233 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 IFNKQ9P0W0 207 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 ITIH6Q6UXX5 1313 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 A0A1B0GTH6 734 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 A0A1W2PPC4 97 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 FAM149AA5PLN7 773 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 F5H5T6 163 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 CBX4O00257 560 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 MOCS3O95396 460 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 SERPINC1P01008 464 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 CCT8P50990 548 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 ZNF75DP51815 510 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 ARID5BQ14865 1188 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 MEA1Q16626 185 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 MIIPQ5JXC2 388 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 FBXL22Q6P050 247 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 GATAD2AQ86YP4 633 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 KDM1BQ8NB78 822 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms