RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-208ENST00000427110 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-208ENST00000427110 HEATR4Q86WZ0 1026 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-208ENST00000427110 RHPN2Q8IUC4 686 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-208ENST00000427110 CPOQ8IVL8 374 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-208ENST00000427110 VPS52Q8N1B4 723 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-208ENST00000427110 ESX1Q8N693 406 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-208ENST00000427110 NANOGP1Q8N7R0 232 aa2.7□□□□□ -1.98
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PTPRC-208ENST00000427110 ARL15Q9NXU5 204 aa2.69□□□□□ -1.98
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PTPRC-208ENST00000427110 SEMA5BQ9P283 1151 aa2.69□□□□□ -1.98
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PTPRC-208ENST00000427110 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa2.69□□□□□ -1.98
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PTPRC-208ENST00000427110 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
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PTPRC-208ENST00000427110 CBWD5Q5RIA9 395 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-208ENST00000427110 C10orf76Q5T2E6 689 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-208ENST00000427110 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.68□□□□□ -1.98
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