RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 PPM1JQ5JR12 505 aa28.02■■■□□ 2.08
GNPTAB-202ENST00000392919 FBXL22Q6P050 247 aa28.02■■■□□ 2.08
GNPTAB-202ENST00000392919 LPCAT2Q7L5N7 544 aa28.02■■■□□ 2.08
GNPTAB-202ENST00000392919 C14orf80Q86SX3 495 aa28.02■■■□□ 2.08
GNPTAB-202ENST00000392919 CFAP52Q8N1V2 620 aa28.02■■■□□ 2.08
GNPTAB-202ENST00000392919 SPC24Q8NBT2 197 aa28.02■■■□□ 2.08
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC2A11Q9BYW1 496 aa28.02■■■□□ 2.08
GNPTAB-202ENST00000392919 CD93Q9NPY3 652 aa28.02■■■□□ 2.08
GNPTAB-202ENST00000392919 TM4SF5O14894 197 aa28.01■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 DEFB119Q8N690 84 aa28.01■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 FNIP1Q8TF40 1166 aa28.01■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 PIGKQ92643 395 aa28.01■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 HAPLN3Q96S86 360 aa28.01■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 SIK2Q9H0K1 926 aa28.01■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 STIM2Q9P246 746 aa28.01■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 IMPACTQ9P2X3 320 aa28.01■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 STON1Q9Y6Q2 735 aa28.01■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 H2AFZP0C0S5 128 aa28■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 PSMA2P25787 234 aa28■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 ADRA1BP35368 520 aa28■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 ARTNQ5T4W7 220 aa28■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM215Q68D42 235 aa28■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 IL31Q6EBC2 164 aa28■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 H2AFVQ71UI9 128 aa28■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF683Q8IZ20 524 aa28■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 WFDC5Q8TCV5 224 aa28■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 IGSF8Q969P0 613 aa28■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 C1orf74Q96LT6 269 aa28■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 EDEM2Q9BV94 578 aa28■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM74BQ9NUR3 256 aa28■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 VANGL2Q9ULK5 521 aa28■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 LNP1A1A4G5 178 aa27.99■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 IL12RB1P42701 662 aa27.99■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 C5orf22Q49AR2 442 aa27.99■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa27.99■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa27.99■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC185Q8N715 623 aa27.99■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 SORCS1Q8WY21 1168 aa27.99■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 MRGPRX1Q96LB2 322 aa27.99■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 NUP85Q9BW27 656 aa27.99■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 CYP8B1Q9UNU6 501 aa27.99■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa27.98■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 HLA-FP30511 346 aa27.98■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 IRAK1P51617 712 aa27.98■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 ARL13BQ3SXY8 428 aa27.98■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 NTAN1Q96AB6 310 aa27.98■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 LMLNQ96KR4 655 aa27.98■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 ELOVL2Q9NXB9 296 aa27.98■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 CEP192Q8TEP8 1941 aa27.98■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM253P0C7T8 217 aa27.97■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 KCNA4P22459 653 aa27.97■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 IRX4P78413 519 aa27.97■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 ENPP2Q13822 863 aa27.97■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 RABGAP1LQ5R372 815 aa27.97■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 SCYL2Q6P3W7 929 aa27.97■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 FIBINQ8TAL6 211 aa27.97■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 MAGEB5Q9BZ81 275 aa27.97■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 CIPCQ9C0C6 399 aa27.97■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 GON4LQ3T8J9 2241 aa27.97■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 C4orf47A7E2U8 309 aa27.96■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 ITPKAP23677 461 aa27.96■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 SCAPQ12770 1279 aa27.96■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF234Q14588 700 aa27.96■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 FUT11Q495W5 492 aa27.96■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 MFN1Q8IWA4 741 aa27.96■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC170Q8IYT3 715 aa27.96■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 CARNMT1Q8N4J0 409 aa27.96■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP27.96■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 BTBD6Q96KE9 485 aa27.96■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 OSBPL2Q9H1P3 480 aa27.96■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 GRPEL1Q9HAV7 217 aa27.96■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 ABCB8Q9NUT2 735 aa27.96■■■□□ 2.07
GNPTAB-202ENST00000392919 DRGXA6NNA5 263 aa27.95■■■□□ 2.06
GNPTAB-202ENST00000392919 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
GNPTAB-202ENST00000392919 LCA5LO95447 670 aa27.95■■■□□ 2.06
GNPTAB-202ENST00000392919 DESP17661 470 aa27.95■■■□□ 2.06
GNPTAB-202ENST00000392919 CD70P32970 193 aa27.95■■■□□ 2.06
GNPTAB-202ENST00000392919 FSCBQ5H9T9 825 aa27.95■■■□□ 2.06
GNPTAB-202ENST00000392919 LYSMD4Q5XG99 296 aa27.95■■■□□ 2.06
GNPTAB-202ENST00000392919 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
GNPTAB-202ENST00000392919 TMTC1Q8IUR5 882 aa27.95■■■□□ 2.06
GNPTAB-202ENST00000392919 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
GNPTAB-202ENST00000392919 UCMAQ8WVF2 138 aa27.95■■■□□ 2.06
GNPTAB-202ENST00000392919 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
GNPTAB-202ENST00000392919 ANAPC7Q9UJX3 599 aa27.95■■■□□ 2.06
GNPTAB-202ENST00000392919 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
GNPTAB-202ENST00000392919 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms