RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 VANGL2Q9ULK5 521 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 TLL2Q9Y6L7 1015 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 GLRA3O75311 464 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 LRIG2O94898 1065 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 CD68P34810 354 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 ZBTB17Q13105 803 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 STXBP5Q5T5C0 1151 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 FAM171BQ6P995 826 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 METTL23Q86XA0 190 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 KLHDC9Q8NEP7 349 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 HDAC11Q96DB2 347 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 ACBD6Q9BR61 282 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 NMUR2Q9GZQ4 415 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 TLE6Q9H808 572 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 LRRC40Q9H9A6 602 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 TMLHEQ9NVH6 421 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 ARMCX1Q9P291 453 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 EMCNQ9ULC0 261 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 PTPRDP23468 1912 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 MTSS1O43312 755 aa18.02■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 GSRP00390 522 aa18.02■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 GARSP41250 739 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 RAB27AP51159 221 aa18.02■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 GALNT2Q10471 571 aa18.02■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 KRT72Q14CN4 511 aa18.02■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 WASHC2DQ5SRD0 308 aa18.02■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 PM20D1Q6GTS8 502 aa18.02■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 TAC4Q86UU9 113 aa18.02■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 IRGQQ8WZA9 623 aa18.02■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 ADAM2Q99965 735 aa18.02■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 BTBD10Q9BSF8 475 aa18.02■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 GBA3Q9H227 469 aa18.02■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 THAP1Q9NVV9 213 aa18.02■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 DCDC2Q9UHG0 476 aa18.02■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 NLRC5Q86WI3 1866 aa18.02■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 CYP11A1P05108 521 aa18.02■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 ITGB1P05556 798 aa18.02■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 CALB2P22676 271 aa18.02■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 SERPINB6P35237 376 aa18.02■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 GP5P40197 560 aa18.02■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 AQP5P55064 265 aa18.02■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 PPM1JQ5JR12 505 aa18.02■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 SMC1BQ8NDV3 1235 aa18.02■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 OR10T2Q8NGX3 314 aa18.02■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 TMEM209Q96SK2 561 aa18.02■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 PKMYT1Q99640 499 aa18.02■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 CPNE1Q99829 537 aa18.02■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 TRHDEQ9UKU6 1024 aa18.02■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa18.02■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 F8W810 466 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 PLIN3O60664 434 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 TYK2P29597 1187 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 GRTP1Q5TC63 336 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 KCTD11Q693B1 232 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 LRRTM3Q86VH5 581 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 KIRREL3Q8IZU9 778 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 SH3TC2Q8TF17 1288 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 WWP1Q9H0M0 922 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 CASS4Q9NQ75 786 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 NUP205Q92621 2012 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 M0QZQ0 153 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 GYG2O15488 501 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 PEX11AO75192 247 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 SRGAP2BP0DMP2 458 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 GM2AP17900 193 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 NFKB1P19838 968 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 KCNA4P22459 653 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 GRIK3Q13003 919 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 TAF11Q15544 211 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 CERCAMQ5T4B2 595 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 MBLAC2Q68D91 279 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 TMEM135Q86UB9 458 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 APOL2Q9BQE5 337 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa18■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 ARHGAP42A6NI28 874 aa18■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 ATP9BO43861 1147 aa18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms