RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253451.8

CCL25-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CCL25, Length 953 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL25-201ENST00000253451 COG1Q8WTW3 980 aa16.13■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 MUTYHQ9UIF7 546 aa16.13■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 PIAS3Q9Y6X2 628 aa16.13■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 CHD5Q8TDI0 1954 aa16.13■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 CEP104O60308 925 aa16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 CST8O60676 142 aa16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 MAP3K6O95382 1288 aa16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 HLA-FP30511 346 aa16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 CTHP32929 405 aa16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 CETN2P41208 172 aa16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 CSKP41240 450 aa16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 AMPD2Q01433 879 aa16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 PFKPQ01813 784 aa16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 GBE1Q04446 702 aa16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 TXNDC11Q6PKC3 985 aa16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 NPNTQ6UXI9 565 aa16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 BBS12Q6ZW61 710 aa16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 CCDC33Q8N5R6 958 aa16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 FIBINQ8TAL6 211 aa16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 HAUS1Q96CS2 278 aa16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 LMLNQ96KR4 655 aa16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 ABCB8Q9NUT2 735 aa16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa16.12■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 ZNF185O15231 689 aa16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 CISD3P0C7P0 127 aa16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 ACVRL1P37023 503 aa16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 DGKGP49619 791 aa16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 GNA12Q03113 381 aa16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 TFDP2Q14188 446 aa16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 C6orf118Q5T5N4 469 aa16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 GRAMD4Q6IC98 578 aa16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 C1orf228Q6PIY5 440 aa16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 SFTPA1Q8IWL2 248 aa16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 PHTF2Q8N3S3 785 aa16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 OR7D4Q8NG98 312 aa16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 ZNF592Q92610 1267 aa16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 MS4A14Q96JA4 679 aa16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 PBKQ96KB5 322 aa16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 SLC2A11Q9BYW1 496 aa16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 RETREG1Q9H6L5 497 aa16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 GGA2Q9UJY4 613 aa16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 FBXO10Q9UK96 956 aa16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 CA14Q9ULX7 337 aa16.11■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 A0A0D9SEW6 157 aa16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 RASA4BC9J798 803 aa16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 RASA4O43374 803 aa16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 RAMP2O60895 175 aa16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 TCP1P17987 556 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 SERPINB6P35237 376 aa16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 GEN1Q17RS7 908 aa16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 FUT11Q495W5 492 aa16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 AFMIDQ63HM1 303 aa16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 TPRG1Q6ZUI0 275 aa16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 APCDD1Q8J025 514 aa16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 ALG14Q96F25 216 aa16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 HMCESQ96FZ2 354 aa16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 CAPZA3Q96KX2 299 aa16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 SLC39A8Q9C0K1 460 aa16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 MUC3BQ9H195 1237 aa16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 LRRC19Q9H756 370 aa16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 DEC1Q9P2X7 70 aa16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 EFR3BQ9Y2G0 817 aa16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 HEY1Q9Y5J3 304 aa16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 NUP205Q92621 2012 aa16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 ILVBLA1L0T0 632 aa16.09■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 SHISA7A6NL88 538 aa16.09■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 DFFAO00273 331 aa16.09■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 TJP3O95049 919 aa16.09■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 FGGP02679 453 aa16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms