RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 TRPC4APQ8TEL6 797 aa6.46□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 ETNK2Q9NVF9 386 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 POLIQ9UNA4 740 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 URADA6NGE7 173 aa6.46□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 SRP72O76094 671 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa6.46□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 E5RJQ4 531 aa6.45□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 DNAJB4Q9UDY4 337 aa6.45□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 TAS2R42Q7RTR8 314 aa6.45□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.45□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.45□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 CNTNAP1P78357 1384 aa6.45□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 PGK2P07205 417 aa6.45□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 LAG3P18627 525 aa6.45□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 WARSP23381 471 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 ANXA6P08133 673 aa6.45□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 FGFR1P11362 822 aa6.45□□□□□ -1.38
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