RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24■■□□□ 1.43
CLN8-211ENST00000636934 BCAR3O75815 825 aa24■■□□□ 1.43
CLN8-211ENST00000636934 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.99■■□□□ 1.43
CLN8-211ENST00000636934 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.99■■□□□ 1.43
CLN8-211ENST00000636934 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.99■■□□□ 1.43
CLN8-211ENST00000636934 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CLN8-211ENST00000636934 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.98■■□□□ 1.43
CLN8-211ENST00000636934 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.98■■□□□ 1.43
CLN8-211ENST00000636934 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CLN8-211ENST00000636934 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CLN8-211ENST00000636934 MSH5O43196 834 aa23.97■■□□□ 1.43
CLN8-211ENST00000636934 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.97■■□□□ 1.43
CLN8-211ENST00000636934 AAMPQ13685 434 aa23.96■■□□□ 1.43
CLN8-211ENST00000636934 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
CLN8-211ENST00000636934 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.96■■□□□ 1.43
CLN8-211ENST00000636934 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
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CLN8-211ENST00000636934 IL16Q14005 1332 aa23.94■■□□□ 1.42
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CLN8-211ENST00000636934 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.93■■□□□ 1.42
CLN8-211ENST00000636934 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
CLN8-211ENST00000636934 EID1Q9Y6B2 187 aa23.93■■□□□ 1.42
CLN8-211ENST00000636934 FCHSD2O94868 740 aa23.92■■□□□ 1.42
CLN8-211ENST00000636934 NEFMP07197 916 aa23.92■■□□□ 1.42
CLN8-211ENST00000636934 ITSN1Q15811 1721 aa23.92■■□□□ 1.42
CLN8-211ENST00000636934 PDE4AP27815 886 aa23.91■■□□□ 1.42
CLN8-211ENST00000636934 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.91■■□□□ 1.42
CLN8-211ENST00000636934 AKAP12Q02952 1782 aa23.9■■□□□ 1.42
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CLN8-211ENST00000636934 POLKQ9UBT6 870 aa23.9■■□□□ 1.42
CLN8-211ENST00000636934 BACH2Q9BYV9 841 aa23.89■■□□□ 1.42
CLN8-211ENST00000636934 SLIT1O75093 1534 aa23.89■■□□□ 1.41
CLN8-211ENST00000636934 C3P01024 1663 aa23.89■■□□□ 1.41
CLN8-211ENST00000636934 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
CLN8-211ENST00000636934 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.88■■□□□ 1.41
CLN8-211ENST00000636934 COG3Q96JB2 828 aa23.88■■□□□ 1.41
CLN8-211ENST00000636934 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.87■■□□□ 1.41
CLN8-211ENST00000636934 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.86■■□□□ 1.41
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CLN8-211ENST00000636934 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
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CLN8-211ENST00000636934 RIPK4P57078 832 aa23.85■■□□□ 1.41
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CLN8-211ENST00000636934 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.85■■□□□ 1.41
CLN8-211ENST00000636934 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.84■■□□□ 1.41
CLN8-211ENST00000636934 NME9Q86XW9 330 aa23.83■■□□□ 1.41
CLN8-211ENST00000636934 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
CLN8-211ENST00000636934 DIP2AQ14689 1571 aa23.83■■□□□ 1.41
CLN8-211ENST00000636934 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.4
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CLN8-211ENST00000636934 PANK1Q8TE04 598 aa23.82■■□□□ 1.4
CLN8-211ENST00000636934 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.82■■□□□ 1.4
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CLN8-211ENST00000636934 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
CLN8-211ENST00000636934 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
CLN8-211ENST00000636934 COG6Q9Y2V7 657 aa23.81■■□□□ 1.4
CLN8-211ENST00000636934 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
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CLN8-211ENST00000636934 PRKAR2BP31323 418 aa23.79■■□□□ 1.4
CLN8-211ENST00000636934 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.79■■□□□ 1.4
CLN8-211ENST00000636934 PTCH1Q13635 1447 aa23.79■■□□□ 1.4
CLN8-211ENST00000636934 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.78■■□□□ 1.4
CLN8-211ENST00000636934 IL13P35225 146 aa23.78■■□□□ 1.4
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CLN8-211ENST00000636934 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.77■■□□□ 1.4
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CLN8-211ENST00000636934 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.75■■□□□ 1.39
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CLN8-211ENST00000636934 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.74■■□□□ 1.39
CLN8-211ENST00000636934 ZNF428Q96B54 188 aa23.74■■□□□ 1.39
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CLN8-211ENST00000636934 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 IGHDP01880 384 aa23.7■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 HMOX1P09601 288 aa23.7■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 RLBP1P12271 317 aa23.7■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.7■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.7■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
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